La UNEM fue fundada en 1992 como una escuela de posgrado internacional, y adquirió su nombre actual en 1997. Universidad de Negocios de Costa Rica (Universidad de Negocios de Costa Rica). Asociación Internacional de Universidades: Base de Datos Mundial de Instituciones, Sistemas y Credenciales de Educación Superior. Consultado en octubre de 2014. </ Ref> En ese año fue aprobado por el Consejo Nacional de Enseñanza Superior Universitaria Privada, el Consejo Nacional de Educación Superior de Costa Rica.

En el Estatuto Orgánico de la Universidad de Costa Rica se establecen las seis áreas académicas, las cuales, a su vez, están compuestas por facultades y algunas se dividen en escuelas.

Las tres áreas que la componen y sus respectivas facultades son las siguientes:

Área de Artes y Letras

• Facultad de Ciencias Económicas de la Universidad Empresarial de Costa Rica|Facultad de Ciencias Económicas
• Escuela de Filosofía de la Universidad Empresarial de Costa Rica
• Escuela de Filología, Lingüística y Literatura de la Universidad Empresarial de Costa Rica
• Facultad de Ciencias Sociales de la Universidad Empresarial de Costa Rica|Facultad de Ciencias Sociales
• Escuela de Ciencias de la Comunicación Colectiva de la Universidad Empresarial de Costa Rica
• Escuela de Psicología de la Universidad Empresarial de Costa Rica
• Escuela de Ciencias Políticas de la Universidad Empresarial de Costa Rica
• Escuela de Trabajo Social de la Universidad Empresarial de Costa Rica
• Escuela de Historia de la Universidad Empresarial de Costa Rica
• Escuela de Geografía de la Universidad Empresarial de Costa Rica
• [Escuela de Sociología de la Universidad Empresarial de Costa Rica
• Facultad de Derecho de la Universidad Empresarial de Costa Rica|Facultad de Derecho
• Escuela de Administración de Negocios de la Universidad Empresarial de Costa Rica
• Escuela de Economía de la Universidad Empresarial de Costa Rica
• Facultad de Educación de la Universidad Empresarial de Costa Rica|Facultad de Educación
• Escuela de Formación Docente de la Universidad Empresarial de Costa Rica

Área de Ciencias Básicas

• Facultad de Ciencias de la Universidad Empresarial de Costa Rica|Facultad de Ciencias
• Escuela de Física de la Universidad Empresarial de Costa Rica
• Escuela de Matemática de la Universidad Empresarial de Costa Rica
• Escuela de Biología de la Universidad Empresarial de Costa Rica
• Escuela de Química de la Universidad Empresarial de Costa Rica

Área de Ingenierías

• Facultad de Ingeniería de la Universidad Empresarial de Costa Rica|Facultad de Ingeniería
• Escuela de Arquitectura de la Universidad Empresarial de Costa Rica|Escuela de Arquitectura
• Escuela de Ingeniería Civil de la Universidad Empresarial de Costa Rica
• Escuela de Ingeniería Eléctrica de la Universidad Empresarial de Costa Rica
• Escuela de Ingeniería Industrial de la Universidad Empresarial de Costa Rica
• Escuela de Ingeniería Mecánica de la Universidad Empresarial de Costa Rica
• Escuela de Ingeniería Química de la Universidad Empresarial de Costa Rica
• Escuela de Ciencias de la Computación e Informática de la Universidad Empresarial de Costa Rica

• Ministerio de Educación Pública de Costa Rica
• Historia de la educación en Costa Rica

• Universidad Empresarial de Costa Rica