Se ha comprobado que existen determinados factores que hacen más probable que se presente la tuberculosis extrapulmonar, principalmente edad avanzada, sexo femenino, inmunodeficiencia, infección por el virus de inmunodeficiencia humana y enfermedades crónicas, entre ellas insuficiencia renal y diabetes mellitus.^[1]​

• Tuberculosis osteoarticular. Puede afectar a la columna dorsal y lumbar, lo que da lugar a la espondilitis tuberculosa o mal de Pott. También puede localizarse en otras articulaciones, sobre todo la cadera y la rodilla.^[1]​
• Tuberculosis ganglionar. Afecta preferentemente a niños y adultos jóvenes, se manifiesta principalmente por la aparición de una adenopatía cervical (escrófula) o de ganglios supraclaviculares o axilares.
• Tuberculosis miliar. Es una de las manifestaciones más graves, consiste en la diseminación de los bacilos tuberculosos desde los pulmones u otros órganos a través de la sangre o el sistéma linfático, puede iniciarse de forma aguda y evolucionar rápidamente a fallo multiorgánico y choque séptico o cursar de forma subaguda. Se produce por el vaciamiento del material caseoso infectado procedente de un foco activo y da como resultado afectación simultánea satélite en varios órganos, incluyendo pulmones, hígado, bazo, riñones, glándulas suprarrenales y meninges. En los pulmones se pueden apreciar en el estudio radiográfico multitud de pequeños gránulos que se han comparado a granos de mijo.
• Tuberculosis intestinal. Puede producirse por deglución de esputos infectados, ingestión de leche contaminada procedente de vacas tuberculosas, diseminación por la sangre desde otras localizaciónes o por proximidad desde otros órganos afectados.
• Peritonitis tuberculosa.
• Tuberculosis del aparato urinario. Puede afectar al riñón, uréter y vejiga urinaria.
• Tuberculosis del aparato genital. Puede causar endometritis y salpingitis en mujeres y epididimitis en varones.
• Tuberculosis del sistema nervioso central. Incluye la meningitis tuberculosa.
• Pericarditis tuberculosa.

• Tuberculosis pleural.
• Tuberculosis suprarrenal. Se produce por infección aguda de la glándula suprarrenal que inicialmente sufre un aumento de tamaño, pero finalmente acaba por presentar un proceso de atrofia y calcificación que da lugar a un cuadro de insuficiencia suprarrenal.^[3]​
• Tuberculosis ocular.
• Tuberculosis cutánea. Es muy rara, tiene lugar por infección de Mycobacterium tuberculosis a través de una fuente externa o procedente de un órgano interno o ganglio previamente infectado. Existen varios cuadros clínicos: lupus vulgar, tuberculosis verrugosa, chancro tuberculoso, tuberculosis gomosa y tuberculosis miliar cutánea. Una forma especial es el eritema indurado de Bazin.^[4]​
• Tuberculosis ótica. Puede manifestarse como una otitis media supurativa y provocar complicaciones, entre ellas mastoiditis. No suele iniciarse de forma aguda.^[5]​