La red de carreteras de Santander está conformada por 1200 kilómetros de Red Primaria, a cargo de la Nación y de los cuales 800 están pavimentados, por 3469 kilómetros de Carreteras Secundarias, a cargo del departamento, de las cuales 436 pavimentadas, y por 6181 kilómetros de Red Terciaria, a cargo de los municipios. En total hay disponibilidad de 10.850 kilómetros de carreteras.

La formación del sector transporte en Santander está dividido en vías de transportes Principales, Secundarias y terciarias.

• Se destaca como vía principal la Troncal Central (Ruta Nacional 45A) que une a Bogotá - Barbosa - Oiba - Socorro - San Gil - Aratoca - Piedecuesta - Floridablanca - Bucaramanga - Rionegro - El Playón - San Alberto (Cesar).
• La Troncal del Magdalena (Ruta Nacional 45) , que une a Puerto Boyacá - Puerto Araujo - Lizama - Sabana de Torres y San Alberto (Cesar).
• La Transversal (Ruta Nacional 66) que une a Curos - Guaca - Málaga. La de Barrancabermeja - Bucaramanga - Cúcuta.
• La Troncal Central del Norte (Ruta Nacional 55), que comunica a Bogotá - Duitama - Málaga y Pamplona (Norte de Santander).
• La Transversal del Carare (Ruta Nacional 62) que comunica a Barbosa - Vélez - Landázuri - Puerto Araujo.
• Finalmente, la que une a los municipios de San Gil - Charalá - Duitama y San Gil - Mogotes - San Joaquín - Onzaga y Soatá.

Existe una vía férrea de 117 kilómetros entre Bucaramanga y Puerto Wilches, pero hoy está inactiva. Conecta con 210 kilómetros de la línea del Ferrocarril del Atlántico. Su conservación a cargo de Ferrocarriles de la Paz conformados por empresa oficiales y privadas de Santander y el Cesar. Hay servicio entre Puerto Berrío – Puerto Parra – Barrancabermeja - Puerto Wilches – La Costa Atlántica. Se trabaja para establecer el servicio internodal con transferencias en Barrancabermeja, Bucaramanga, Puerto Wilches, Puerto Parra y Sabana de Torres.

El mayor y más importante aeropuerto está en el municipio de Lebrija, situado a 30 minutos de Bucaramanga vía terrestre y se denomina "Palonegro". Sirve al Área Metropolitana de Bucaramanga y es de carácter internacional. Uno de los mejores del país, de gran actividad en materia de carga y pasajeros. Tiene conexiones directas a Bogotá, Medellín, Cartagena, Santa Marta, Barranquilla, Cúcuta, Arauca, Saravena, Cali, Yopal y Villavicencio en el país, y fuera de este a Ciudad de Panamá, Fort Lauderdale y Miami, estos dos últimos en Estados Unidos. También realiza vuelos charter de manera intermitente a Sabana de Torres, San Gil y Málaga por medio de empresas regionales. Otro aeropuerto de importancia es el Aeropuerto Yariguies en Barrancabermeja, que tiene línea directa con Bogotá y Medellín.

Aeropuertos alternos en: Puerto Wilches, Sabana de Torres, San Vicente, El Carmen, Zapatoca, Málaga, Socorro, San Gil, Cimitarra y Barbosa. A estos aeropuertos viajan pequeñas empresas regionales en vuelos charter y avionetas pequeñas de manera muy ocasional, cuyas operaciones son manejadas desde Bucaramanga. Los que presentan una actividad para considerar relevante son el de Málaga (Aeropuerto Jerónimo de Aguayo) y San Gil (Aeropuerto Los Pozos, recientemente remodelado y en espera de comenzar vuelos comerciales a Bogotá y Medellín y viceversa).

El Río Magdalena en una extensión de 240 kilómetros se constituye en red fluvial primaria para el transporte de carga. Los puertos generadores del servicio vial fluvial son Barrancabermeja, Puerto Wilches y Puerto Olaya. Se evidencia la falta de mantenimiento del río que hoy recorre a varios kilómetros de donde estaba el muelle de Barrancabermeja. Instalaciones portuarias casi inexistentes. Hay muchos lancheros de turismo y pequeños transportes de carga para distancias cortas.