El torneo comprendió una primera fase en la que los equipos jugaron bajo el sistema todos contra todos a visita recíproca. Los equipos que ocuparon los cuatro primeros lugares en la tabla de posiciones clasificaron a la segunda fase.

En la segunda fase se disputaron las semifinales del torneo, en el que el primer lugar de la tabla de posiciones jugó contra el cuarto, y el segundo contra el tercero. Los partidos fueron a visita recíproca, y los dos primeros lugares decidieron si jugaban de local o visitante en la primera fecha.^[6]​ En caso de igualdad en puntos y goles de diferencia en los juegos de la semifinal, pasó a la final del torneo el equipo que ocupó la mejor posición en la tabla. La final se jugó a partido único, y de haber persistido la igualdad tras los noventa minutos, hubo tiempo extra, y en última instancia los tiros desde el punto penal.

En este torneo se decidió el descenso a la Segunda División mediante una tabla acumulada con respecto al Torneo Apertura 2012, y correspondió al equipo que acumuló el menor número de puntos en los treinta y seis juegos de la temporada regular.

Las empresas que transmiten los juegos por televisión en El Salvador son: Telecorporación Salvadoreña, a través de canal 4, desde ocho estadios del país; y canal 21 de Megavisión El Salvador, que lo hace desde el estadio Las Delicias de Santa Tecla.