La primera temporada de The Last Ship comienza cuando un virus diezma a la población del planeta, al arrasar más del 80% de la población mundial.^[8]​ Sin embargo, gracias a su posición en el momento en que sucede la pandemia, el buque de guerra estadounidense USS Nathan James liderado por el capitán Thomas "Tom" Chandler consigue evitar contagiarse de la enfermedad.

Conforme pasan los días, el buque y su tripulación, que consta de más de 218 hombres y mujeres, se verán obligados a afrontar la nueva realidad, mientras que descubren que la doctora Rachel Scott a bordo del James les había ocultado que son algunos de los últimos supervivientes del mundo, mientras que tendrán que ayudarla para encontrar la cura para detener el virus y así salvar al resto de la humanidad.

En la segunda temporada, han logrado desarrollar la cura y ahora se enfrentan al reto de regresar a casa. Sin embargo se encuentran con varios problemas. Se dan cuenta de las consecuencias y los estragos que ha traído el virus a la sociedad en general, convirtiéndola en egoísta y cruel. Tienen la decisión de volver con sus familias; sin embargo, deciden tomar la misión de repartir la cura a todos. Durante el final, el equipo logra detener los hermanos Ramsey, quienes habían influido en la población haciéndoles creer que los inmunes a la enfermedad son los herederos legítimos de la sociedad. Danny y Kara se comprometen y, finalmente, la doctora Rachel Scott muere tras recibir varios disparos por parte de Curtis, creyente fanático de los inmunes.

En la tercera temporada, Danny y Kara están casados y tienen un hijo, Frankie. Los tripulantes del Nathan James se dedican a llevar la cura a todo el mundo. Lamentablemente deben enfrentarse a los corruptos miembros del gobierno chino y a piratas por el océano Pacífico. Por otro lado Kara, que fue promovida a Jefa de Operaciones Navales, descubre que dentro del equipo del presidente de los Estados Unidos hay gente corrupta que le está pasando información a los enemigos. Los piratas japoneses secuestran a varios miembros de la tripulación pues los acusan de exterminar a la población japonesa con una falsa cura, mientras que los chinos intentan asesinar al capitán Chandler al estallar el avión donde viajaba. Se descubre una gran conspiración de los chinos para eliminar a sus países vecinos, y nuestros héroes con ayuda de los piratas japoneses logran evitar la exterminación de Corea y ponerle fin al terrible plan del presidente chino. Durante el final de la temporada el equipo logra detener a varios senadores corruptos y la corrupta jefa de gabinete Allison Shaw quienes habían dividido al país como un botín; y puesto al capitán Chandler y a su tripulación como traidores.

• USS Nathan James (DDG-151): fue un destructor de clase Arleigh Burke de la Marina de los Estados Unidos, se encuentra bajo el mando del capitán Thomas Chandler. Recientemente el capitán Mike Slattery tomó el mando del destructor luego de que Thomas fuera promovido a Jefe de Operaciones Navales del Presidente.
• USS Hayward (DDG-157): fue un destructor de clase Arleigh Burk de la Marina de los Estados Unidos, bajo el mando del capitán Joseph "Joe" Meylan y XO. Cobb es la segunda al mando. El Hayward es una de los tres buques activos de la Marina junto con el "USS Nathan James" y el "Shackelton". Durante un enfrentamiento con los Chinos, el Hayward es severamente dañado, varios de sus tripulantes mueren, mientras que Meylan y otros marinos heridos son rescatados por el Nathan James, más tarde destruyen el barco. Otros miembros del Hayward son King y Plumber.
• USS Shackleton (DDG-162): fue un destructor de clase Arleigh Burke de la Marina de los Estados Unidos, bajo el mando del capitán Hicks. Durante un enfrentamiento con los Chinos, el Shackleton es destruido luego de ser impactado por misiles chinos, todos sus tripulantes murieron. O'Connor fue miembro del USS Shackleton antes de ser enviado al USS Hayward.
• USNS Solace (T-AH-21): fue un barco hospital de clase Mercy de la Marina de los Estados Unidos, para escapar del virus de la gripe roja, el Solace navegó en alta mar con una tripulación mínima y 15 científicos, así como equipos para la creación de un bio-laboratorio para producir la cura. Poco después un grupo liderado por el criminal Ned Ramsey llega en el barco y mata a la mayoría de la tripulación.
• USS Jeffrey Michener (LHD-20): es un buque de asalto anfibio de clase Wasp que sirvió como buque insignia de la Flota de los Estados Unidos recientemente restablecida y se puso bajo el mando del Almirante Mike Slattery y el Capitán Andrea Garnet. El barco lleva el nombre del difunto presidente Jeffrey Michener. En el primer episodio de la quinta temporada es atacado por aviones de la fuerza aérea de la Gran Colombia,es reparado y en el noveno episodio aparece junto al Nathan James para llevar a cabo el plan de invasión a Sudamérica contra las fuerzas de Gustavo Barros.
• HMS Achilles: fue un submarino nuclear de la Marina Real Británica, el cual fue tomado por el criminal Sean Ramsey y su hermano Ned para destruir al "USS Nathan James" y la cura que llevaban para el virus. Ambos hermanos entrenaron al resto de la tripulación que no había sido afectada por el virus como mercenarios. Los Ramsey y su tripulación usan los misiles Tomahawk del submarino para destruir todos los laboratorios que estaban produciendo la cura y posteriormente intentan destruir y hundir al destructor sin embargo no lo logran y el submarino termina siendo destruido por el Nathan James.
• RFS Vyerni: fue un crucero de clase Kirov que perteneció a la Armada de Rusia y fue miembro de la Flota del Norte. El Vyerni estaba bajo el mando del renombrado almirante Ruskov. Después de la pandemia el almirante y su tripulación navegaban sin rumbo y cuando descubrieron que el Nathan James tenía la cura intentaron destruirlo y secuestrar a la doctora Rachel para que produjera la cura para ellos y así convertirse en los nuevos "dueños" del mundo, sin embargo su plan no resulta y el crucero y su tripulación terminan hundiéndose cuando marinos del Nathan James logran colocar explosivos en él mientras rescataban al capitán Chandler.
• CNS Henan: fue un destructor de clase III Luyang de la Fuerza de Liberación de Guerra del Ejército del Pueblo Chino, bajo el mando del corrupto presidente de China, Peng Wu. En el undécimo episodio de la tercera temporada los miembros del Nathan James logran tomar el barco y arrestan a los integrantes.
• HS Triton (F-471): fue una fragata clase Hydra de la Armada Helénica. Paul Vellek accedió a dar a Grecia el primer lote de cultivos resistentes a la roya roja a cambio del mando del HS Triton y la flota griega.
• HS Demeter (F-473): fue una fragata de la clase Hydra de la Armada helénica. Durante una batalla con Nathan James, fue hundido por un equipo Vulture en un bote pequeño que estrelló un bote lleno de explosivos en el costado del barco, lo que provocó que se consumiera por una explosión masiva y se hundiera.
• HS Proteus (F-467): fue una fragata de la clase Hydra de la Armada helénica. Durante una batalla con el Nathan James, el barco estadounidense logra golpear al Proteus con un misil, hiriendo de muerte a Giorgio Vellek y hundiendo el barco.
• HS Nereus (F-469): fue una fragata de la clase Hydra de la Marina Helénica. Durante una batalla con el Nathan James, se escondió entre dos barcos pesqueros de tamaño similar. Sin embargo, Nathan James disparó torpedos más profundos que los cascos de los barcos de pesca. Los torpedos no alcanzaron a los barcos de pesca, pero golpearon al Nereus en medio del barco y lo hundieron.

La serie fue estrenada el 22 de junio de 2014 en la cadena estadounidense TNT, el 4 de agosto de 2014 en Latinoamérica y el 16 de septiembre de 2014 en España.

El 18 de julio de 2014 fue confirmada una segunda temporada de 13 episodios, la cual se estrenó el 21 de junio de 2015.^[36]​

El 11 de agosto de 2015 se anunció que la serie había sido renovada para una tercera temporada, la cual contaría con 13 episodios, y sería estrenada el 12 de junio de 2016.^[37]​^[38]​ Debido a la masacre ocurrida el 12 de junio de 2016 durante el Tiroteo en la discoteca "Pulse" de Orlando, por respeto a las víctimas del estreno de la tercera temporada fue atrasado,^[39]​ la temporada se estrenó el 19 de junio el 2016.^[40]​

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• The Last Ship en Internet Movie Database (en inglés).
• The Last Ship Official Website
• Deadline TV Series News | The Last Ship
• The Last Ship on TV.com Archivado el 14 de febrero de 2020 en Wayback Machine.