Comenzó a trabajar en la industria cinematográfica a finales de la década de 1990, realizando varios cortometrajes que le valieron el reconocimiento en festivales de cine búlgaros y franceses.^[1]​ En 2000 dirigió Dog's Home, su primer largometraje, y al año siguiente creó la productora Argo Film. En 2002 y 2003, Komandarev dirigió dos largometrajes documentales, antes de completar su segundo largometraje de ficción en 2008: The World Is Big and Salvation Lurks Around the Corner.^[2]​ Esta road movie, rodada con Carlo Ljubek y Miki Manojlović, se distribuyó internacionalmente y ayudó a Stephan Komandarev a ser preseleccionado para el Óscar a la mejor película internacional en Estados Unidos.^[2]​

En la década de 2010, Komandarev siguió realizando documentales. En 2014 y 2017, dirigió dos largometrajes de ficción que abordaban temas sociales de forma muy realista. El primero se titula The Judgment y aborda la crisis migratoria en Europa.^[3]​ El segundo es Taxi Sofia, una película coral sobre la trágica vida cotidiana de los sofiotes en Bulgaria.^[3]​ Se proyectó en la sección Un certain regard del 70.º Festival de Cannes.

Stephan Komandarev es miembro de la Asociación de Directores y Productores Búlgaros. También es miembro de la Academia de Cine Europeo.

• Dog's Home (2000)
• Bread over the Fence (2002)
• Alphabet of Hope (2003)
• El mundo es grande y la salvación acecha a la vuelta de la esquina (2008)
• The Town of Badante Women (2009)
• The Judgment (2014)
• Sailor Stories (2016)
• Taxi Sofía (2017)
• Rounds (2019)
• Life from Life (2021)
• Las lecciones de Blaga (2023)

• Stephan Komandarev en Internet Movie Database (en inglés).