Era miembro de los Assemani, una familia maronita de origen libanés de la que salieron varios orientalistas ilustres y eclesiásticos. Estudió teología en la Universidad de La Sapienza de Roma y se ordenó sacerdote de rito latino y maronita. A la edad de 26 años se trasladó a Siria y Egipto como misionero. En 1778 regresó a Roma para dedicarse a la investigación y a la enseñanza de las lenguas. Se trasladó también a Alemania y Austria y trabajó durante algún tiempo en la Biblioteca imperial de Viena. En 1785 fue nombrado profesor de Lenguas orientales bíblicas en el seminario de Padua; en 1807 obtuvo la misma cátedra en la Universidad de Padua, ciudad en la que murió el 7 de abril de 1821.

• Museo Cufico Naniano / illustrato dall'Abate Simone Assemani. Padova 1787-88. Microfilm-Edition Urbana, Ill.: Univ. of Illinois 1998.
• Sopra le Monete Arabe effigiate. Padua, 1809.
• Spiegazione di due rarissime medaglie cufiche della famiglia degli Ommiadi appartenenti al Museo Majnoni in Milano. Milán, 1818.

• Saggio sull'origine culto letteratura e costumi degli Arabi avanti Maometto. Padua, 1787.
• Globus caelestis Cufico-Arabicus Veliterni Musei Borgiani a Simone Assemano illustratus, praemissa eiusdem De Arabum astronomia dissertatione et adiectis Duabus epistolis Josephi Toaldi. Padua, 1790.
• Catalogo de' Codici Manoscritti Orientali della Bibliotheca Naniana / Compilato dall'Abate Simone Assemani Professore di Lingue Orientali. Padua, 1792.

• G. Levi Della Vida, «ASSEMANI, Simone». En: Dizionario biografico degli Italiani, vol. 4 (on-line)
• A. Pontani, "Nuovi contributi all'archivio di Simone Assemani (1752-1821): la biografia e il carteggio con Giovanni Cristofano Amaduzzi", in Quaderni per la storia dell'Università di Padova, 46 (2013), pp. 61-104.

• Giuseppe Simone Assemani
• Stefano Evodio Assemani
• Giuseppe Luigi Assemani

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