Su primer club fue el de la UNAM , equipo con el que debutó en 1989 en un "duelo universitario" entre Universidad de Guadalajara 1 - Universidad Nacional de México 0. El 21 de febrero de 2010, en la cancha del Estadio Olímpico Universitario; Bernal llegó a 500 partidos en Primera División; después de 21 años de carrera y 4 títulos en el fútbol mexicano.^[1]​

Fue muy criticado al suplir a Jorge Campos y Adolfo Ríos en la portería. Logró jugar durante 2 décadas y en el clausura 2003 logra obtener la titularidad, siendo fundamental en los títulos obtenidos en 2004. El jueves 9 de diciembre de 2010 anuncia su retiro de las canchas a los 40 años de edad después de 21 años de carrera. Es el jugador con más partidos en la historia del club.

Participó con la selección mexicana en 3 ocasiones.

En 2015, es presentado como uno de los 12 participantes famosos que participarán en la Cuarta Temporada del reality show mexicano La Isla.

• Sergio Bernal anunció su retiro definitivo del fútbol el 9 de diciembre de 2010, agradeciendo al Club Universidad y a la afición el gran apoyo recibido durante toda su carrera profesional y debido a su retiro su dorsal 12 fue temporalmente retirado del equipo UNAM.^[2]​^[3]​
• Su último partido disputado fue el 28 de noviembre de 2010 perdiendo 2-0 contra Monterrey en el Estadio Tecnológico, costándoles la eliminación del torneo Torneo Apertura 2010 del fútbol mexicano.^[4]​

• Ficha de Sergio Bernal en la Web oficial de los Pumas de la UNAM