El jurado de la Sección Oficial estuvo formado por:

• Manuel Antín
• Matías Bize
• Lucio Godoy
• Jennifer Green
• Paul Leduc
• Marina Saura
• Yoima Valdés

• Yureru (Indecisión), de Miwa Nishikawa (Japón)
• Zemestan (Es invierno), de Rafi Pitts (Irán)
• Kubrador (La recaudadora de apuestas), de Jeffrey Jeturian (Filipinas)
• Ciudad en celo, de Hernán Gaffet (Argentina)
• Jindabyne, de Ray Lawrence (Australia)
• Derecho de familia, de Daniel Burman (Argentina, España)
• El ciclo Dreyer, de Álvaro del Amor (España)
• Der lebensversicherer (El corredor de seguros), de Bülent Akinci (Alemania)
• Friss levegö (Aire fresco), de Ágnes Kocsis (Hungría)
• Days of glory, de Rachid Bouchareb (Francia, Marruecos, Bélgica)
• Más que a nada en el mundo, de Andrés León y Javier Solar (México)
• Mujeres en el parque, de Felipe Vega (España)
• Omaret yacoubian (El edificio Yacoubian), de Marwan Hamed (Egipto)
• Optimistas, de Goran Paskaljevic (Serbia)

• Azur y Asmar, de Michel Ocelot (Francia, Bélgica, Italia, España)
• Catch a fire, de Philip Noyce (EE. UU.)
• La caja, de Juan Carlos Falcón (España)
• The Queen, de Stephen Frears (Reino Unido, Francia, Italia)
• Una verdad incómoda, de Davis Guggenheim (USA)
• ¡Qué sea rock!, de Sebastian Schindel (Argentina)
• Fraulein, de Andrea Staka (Suiza)
• Once in a lifetime (The extraordinary story of the New York Cosmos), de Paul Crowder y John Dower (Reino Unido, USA)

• Espiga de Oro: Optimistas, de Goran Paskaljevic
• Espiga de Plata: Zemestan (Es invierno), de Rafi Pitts
• Premio "Pilar Miró" al Mejor nuevo director: Hernán Gaffet por Ciudad en celo
• Premio a la mejor actriz: Laura Linney, por Jindabyne
• Premio al mejor actor: Lazar Ristovski, por Optimistas
• Premio a la mejor música: Paul Kelly y Dan Luscombe, por Jindabyne
• Premio a la mejor dirección de fotografía: Mohammad Davoodi, por Zemestan
• Premio del público: Days of glory, de Rachid Bouchared
• Premio FIPRESCI: Fraulein, de Andrea Staka

Premio al mejor documental: Las alas de la vida, de Antoni P. Canet.

Segundos premios: Tres camaradas (Three Cofrades), de Masha Novikova y Goodbye America, de Sergio Oksman.

• Página web oficial de la SEMINCI
• SEMINCI 2006 en hoycinema.com
• http://seminci.es/historico-de-palmares/?ano=2006&itemselec=2