Nacida en Madrid de madre española y padre danés,^[3]​ Aagesen se licenció en Ingeniería Química especializada en medio ambiente en la Universidad Complutense de Madrid (UCM).^[4]​ En 2002 se incorporó a la Administración para formar parte de la Oficina Española del Cambio Climático (OECC), donde centró su actividad en la acción por el clima y la transición energética.^[5]​ Asimismo, desde ese año ejerció como negociadora para la delegación española en la Comisión Marco de la Organización de las Naciones Unidas (ONU) contra el cambio climático y forma parte del Grupo Intergubernamental de Expertos sobre el Cambio Climático.

En junio de 2018 se integró en el Gabinete de la ministra de Transición Ecológica, Teresa Ribera,^[6]​ donde dirigió, coordinó y definió el Plan Nacional Integrado de Energía y Clima 2021-2030 y la Estrategia de Descarbonización a Largo Plazo 2050. Al año siguiente, en 2019, representó a España en la Conferencia de las Naciones Unidas sobre el Cambio Climático de 2019 (COP25) celebrada en Madrid.^[7]​

Posteriormente, en enero de 2020 fue nombrada secretaria de Estado de Energía,^[2]​ segundo cargo más importante de este departamento. Desde esta posición, continuó con las políticas de transición energética, gestionó la política energética durante la pandemia de COVID-19 y la invasión rusa de Ucrania, contribuyó a la aprobación de la excepción ibérica y elaboró la actualización del Plan Nacional Integrado de Energía y Clima (2023-2030).^[8]​^[9]​^[10]​

En noviembre de 2024 se anunció que sería la nueva vicepresidenta tercera del Gobierno y ministra para la Transición Ecológica y el Reto Demográfico, en sustitución de Teresa Ribera,^[11]​ algo ya esperado por la prensa y el sector energético que la consideraban la «candidata natural».^[12]​^[13]​ Prometió el cargo ante el rey Felipe VI el 25 de noviembre, en el Palacio de la Zarzuela.^[14]​

• Cruz de la Orden Civil del Mérito Medioambiental (2013).