El barrio de San Diego es considerado uno de los nuevos barrios de Xochimilco, ya que fue fundado en siglo XVIII. En esta época sus habitantes se dedicaban a la agricultura y ganadería. A finales del siglo XIX existían abundantes manantiales, los cuales fueron afectados por la sequía.

La construcción de la Capilla de San Diego Tlalcozpan es relativamente nueva ya que data de 1975. Antiguamente los habitantes del barrio no contaban con una capilla y realizaban sus fiestas en la iglesia de San Bernardino de Siena.^[2]​

El 13 de noviembre de cada año se festeja a San Dieguito; en esta celebración se realizan diferentes actividades las cuales incluyen, música en vivo, feria y fandango, dando inicio con el tradicional “Brinco del Chinelo” y la quema de fuegos pirotécnicos que la mayordomía en turno se ocupa que se realice con respeto y algarabía.

A finales del siglo XVIII, un número importante de pobladores del pueblo sufrieron de la enfermedad "de los fríos" (paludismo). En este tiempo esta localidad no contaba con un santo determinado y fue por esta razón que los frailes del convento San Bernardino comenzaron la búsqueda de un santo al cual los habitantes se pudieran dirigir y pudieran sanar de la enfermedad. Debido a que San Diego no contaba pueblos bajo su tutela, los frailes decidieron que este se convertiría en el santo del pueblo.^[1]​

La leyenda cuenta que a los pobladores que se atrevían a llamar al santo sin usar su diminutivo, serían atacados por la enfermedad de los fríos; de aquí yace la costumbre de llamar al santo San Dieguito.^[1]​