SATB1 Knowpia

SATB1
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Lista de codigos id de PDB
	1YSE, 2L1P, 2O49, 2O4A, 3NZL, 3TUO, 2MW8
Identificadores
Alias	SATB1, SATB homeobox 1, DEFDA, KTZSL, DNA-binding protein SATB1/SATB2, SATB1/SATB2, IPR039673
IDs externos	OMIM: 602075 MGI: 105084 HomoloGene: 2232 GeneCards: SATB1
Ontología génica
Función molecular	• DNA binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • chromatin binding; • GO:0001948, GO:0016582 unión a proteína plasmática; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • double-stranded DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • sequence-specific DNA binding;
Componente celular	• PML body; • nuclear matrix; • Nucleoplasma; • cromatina; • núcleo celular; • nuclear body;
Proceso biológico	• reflejo; • CD4-positive, alpha-beta T cell differentiation; • CD8-positive, alpha-beta T cell differentiation; • Remodelación de la cromatina; • activated T cell proliferation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization; • transcription, DNA-templated; • epidermis development; • histone methylation; • GO:0022415 proceso viral; • T cell activation;
	Fuentes: Amigo / QuickGO
Patrón de la expressión del ARN
	Más referencias a datos de expressión
Ortólogos
	6304
	20230
	ENSG00000182568
	ENSMUSG00000023927
	Q01826
	Q60611
NM_001131010; NM_001195470; NM_002971; NM_001322871; NM_001322872;
	NM_001322873; NM_001322874; NM_001322875; NM_001322876
NM_001163630; NM_001163631; NM_001163632; NM_009122; NM_001357636;
	NM_001357637; NM_001357638; NM_001357640
NP_001124482; NP_001182399; NP_001309800; NP_001309801; NP_001309802;
	NP_001309803; NP_001309804; NP_001309805; NP_002962
NP_001157102; NP_001157103; NP_001157104; NP_033148; NP_001344565;
	NP_001344566; NP_001344567; NP_001344569
	Wikidata
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La proteína 1 de unión a secuencias ricas en AT (SATB1) es una proteína codificada en humanos por el gen SATB1.^[3]

Función

SATB1 es un factor de transcripción y un organizador global de la cromatina, que ha emergido como un factor clave en la integración de la arquitectura de la cromatina por medio de regulación de la expresión génica.^[4] Estudios recientes han revelado el papel de SATB1 en la organización de la cromatina loopscape y su naturaleza dinámica en respuesta a estímulos fisiológicos.^[5] A nivel de genoma, SATB1 parece desempeñar un papel importante en la organización de la cromatina transcripcionalmente activa. SATB1 organiza el locus del MHC-I en distintos bucles de la cromatina, mediante el reclutamiento de MARs a la matriz nuclear a una distancia fija. El silenciamiento de SATB1 mimetiza los efectos del tratamiento con interferón gamma en la arquitectura de la cromatina del locus del MHC-I, y altera la expresión de genes dentro de ese locus. SATB1 también parece inducir cáncer de mama y metástasis debido a la alteración de la expresión de numerosos genes.

Interacciones

La proteína SATB1 ha demostrado ser capaz de interaccionar con:

Referencias

↑ «Human PubMed Reference:».
↑ «Mouse PubMed Reference:».
↑ «Entrez Gene: SATB1 SATB homeobox 1».
↑ Pavan Kumar P, Purbey PK, Sinha CK, Notani D, Limaye A, Jayani RS, Galande S (abril de 2006). «Phosphorylation of SATB1, a global gene regulator, acts as a molecular switch regulating its transcriptional activity in vivo». Mol. Cell 22 (2): 231-43. PMID 16630892. doi:10.1016/j.molcel.2006.03.010.
↑ Galande S, Purbey PK, Notani D, Kumar PP (octubre de 2007). «The third dimension of gene regulation: organization of dynamic chromatin loopscape by SATB1». Curr. Opin. Genet. Dev. 17 (5): 408-14. PMID 17913490. doi:10.1016/j.gde.2007.08.003.
↑ ^a ^b ^c ^d ^e Yasui, Dag; Miyano Masaru, Cai Shutao, Varga-Weisz Patrick, Kohwi-Shigematsu Terumi (Oct. de 2002). «SATB1 targets chromatin remodelling to regulate genes over long distances». Nature (England) 419 (6907): 641-5. ISSN 0028-0836. PMID 12374985. doi:10.1038/nature01084.
↑ Liu, J; Barnett A, Neufeld E J, Dudley J P (Jul. de 1999). «Homeoproteins CDP and SATB1 interact: potential for tissue-specific regulation». Mol. Cell. Biol. (UNITED STATES) 19 (7): 4918-26. ISSN 0270-7306. PMID 10373541.
↑ Durrin, Linda K; Krontiris Theodore G (Jun. de 2002). «The thymocyte-specific MAR binding protein, SATB1, interacts in vitro with a novel variant of DNA-directed RNA polymerase II, subunit 11». Genomics (United States) 79 (6): 809-17. ISSN 0888-7543. PMID 12036295. doi:10.1006/geno.2002.6772.

Enlaces externos

Literatura del gen SATB1 a través de RARe-SOURCE

Datos: Q18031378
Multimedia: DNA-binding protein SATB1 / Q18031378

[1] «Human PubMed Reference:».

[2] «Mouse PubMed Reference:».

[entrez-3] «Entrez Gene: SATB1 SATB homeobox 1».

[pmid16630892-4] Pavan Kumar P, Purbey PK, Sinha CK, Notani D, Limaye A, Jayani RS, Galande S (abril de 2006). «Phosphorylation of SATB1, a global gene regulator, acts as a molecular switch regulating its transcriptional activity in vivo». Mol. Cell 22 (2): 231-43. PMID 16630892. doi:10.1016/j.molcel.2006.03.010.

[pmid17913490-5] Galande S, Purbey PK, Notani D, Kumar PP (octubre de 2007). «The third dimension of gene regulation: organization of dynamic chromatin loopscape by SATB1». Curr. Opin. Genet. Dev. 17 (5): 408-14. PMID 17913490. doi:10.1016/j.gde.2007.08.003.

[pmid12374985-6] Yasui, Dag; Miyano Masaru, Cai Shutao, Varga-Weisz Patrick, Kohwi-Shigematsu Terumi (Oct. de 2002). «SATB1 targets chromatin remodelling to regulate genes over long distances». Nature (England) 419 (6907): 641-5. ISSN 0028-0836. PMID 12374985. doi:10.1038/nature01084.

[pmid10373541-7] Liu, J; Barnett A, Neufeld E J, Dudley J P (Jul. de 1999). «Homeoproteins CDP and SATB1 interact: potential for tissue-specific regulation». Mol. Cell. Biol. (UNITED STATES) 19 (7): 4918-26. ISSN 0270-7306. PMID 10373541.

[pmid12036295-8] Durrin, Linda K; Krontiris Theodore G (Jun. de 2002). «The thymocyte-specific MAR binding protein, SATB1, interacts in vitro with a novel variant of DNA-directed RNA polymerase II, subunit 11». Genomics (United States) 79 (6): 809-17. ISSN 0888-7543. PMID 12036295. doi:10.1006/geno.2002.6772.

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Summary

Función

Interacciones

Referencias

Enlaces externos