El Registro Mundial de Especies Marinas acepta las siguientes especies válidas en el género:^[1]​

• Phyllidia alyta Yonow, 1996
• Phyllidia babai Brunckhorst, 1993
• Phyllidia carlsonhoffi Brunckhorst, 1993
• Phyllidia coelestis Bergh, 1905
• Phyllidia elegans Bergh, 1869
• Phyllidia exquisita Brunckhorst, 1993
• Phyllidia flava Aradas, 1847
• Phyllidia goslineri Brunckhorst, 1993
• Phyllidia guamensis (Brunckhorst, 1993)
• Phyllidia haegeli (Fahrner & Beck, 2000)
• Phyllidia koehleri Perrone, 2000
• Phyllidia larryi (Brunckhorst, 1993)
• Phyllidia madangensis Brunckhorst, 1993
• Phyllidia marindica (Yonow & Hayward, 1991)
• Phyllidia multituberculata C. R. Boettger, 1918
• Phyllidia ocellata Cuvier, 1804
• Phyllidia orstomi Valdés, 2001
• Phyllidia picta Pruvot-Fol, 1957
• Phyllidia polkadotsa Brunckhorst, 1993
• Phyllidia rueppelii (Bergh, 1869)
• Phyllidia scottjohnsoni Brunckhorst, 1993
• Phyllidia tula Marcus & Marcus, 1970
• Phyllidia varicosa Lamarck, 1801
• Phyllidia willani Brunckhorst, 1993
• Phyllidia zebrina Baba, 1976

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  Phyllidia alyta
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  Phyllidia babai
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  Phyllidia carlsonhoffi
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  Phyllidia coelestis
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  Phyllidia elegans
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  Phyllidia exquisita
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  Phyllidia flava
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  Phyllidia koehleri
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  Phyllidia marindica
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  Phyllidia multituberculata
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  Phyllidia ocellata
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  Phyllidia picta
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  Phyllidia rueppelii
•  
  Phyllidia tula
•  
  Phyllidia varicosa

• Brunckhorst D.J. (1993) The systematics and phylogeny of phyllidiid nudibranchs (Doridoidea). Records of the Australian Museum suppl. 16: 1-108. (en inglés)
• Gofas, S.; Le Renard, J.; Bouchet, P. (2001). Mollusca. in: Costello, M.J. et al. (Ed.) (2001). European register of marine species: a check-list of the marine species in Europe and a bibliography of guides to their identification. Collection Patrimoines Naturels. 50: pp. 180-213. (en inglés)
• Ángel Valdés (2003). Preliminary Molecular Phylogeny of the Radula-less Dorids (gastropoda: opisthobranchia), Based on 16S mtDNA Sequence Data. J. Moll. Stud. 69 (1): 75–80. doi:10.1093/mollus/69.1.75. | pdf completo| extracto (en inglés)
• Bouchet, P. & Rocroi, J.-P. 2005. Classification and Nomenclator of Gastropod Families. Malacologia 47 (1-2): 397 pp.. (Sep 2005) (en inglés)
• Gary R. McDonald. July 29, (2006) Nudibranch Systematic Index. Institute of Marine Sciences. Paper Nudibranch_Systematic_Index. - Nota: Buen recurso para listado de especies de algún género concreto, pero no para familias o superior ya que no se basa en la Taxonomía de Gastropoda (Bouchet & Rocroi, 2005). (en inglés)
• Neville Coleman (2008). Nudibranchs Encyclopedia: Catalogue of Asia/Indo-Pacific Sea Slugs. Neville Coleman's Underwater Geographic. ISBN 0-947325-41-7 (en inglés)
• Dayrat B. 2010. A monographic revision of discodorid sea slugs (Gastropoda, Opisthobranchia, Nudibranchia, Doridina). Proceedings of the California Academy of Sciences, Series 4, vol. 61, suppl. I, 1-403, 382 figs. (en inglés)
• An outline for the classification of Phylum Mollusca in taxonomic databases. Elaborado por editores de WoRMS para uso interno (junio de 2010). (en inglés)

•   Wikimedia Commons alberga una categoría multimedia sobre Phyllidia.
•   Wikispecies tiene un artículo sobre Phyllidia.
• Clasificación de los nudibranquios en:
  • WoRMS(en inglés)
  • ITIS(en inglés)
  • Taxonomicón(en inglés)
  • Catalogue of Life(en inglés)
• Descripción de muchas especies de nudibranquios: Seaslugforum(en inglés)
• Página con gran variedad de recursos dedicada a los nudibranquios: Nudipixel Archivado el 27 de mayo de 2011 en Wayback Machine.(en inglés)