No se tiene certeza acerca de la denominación de esta entidad local. Por un lado, el nombre Peguerillas podría estar relacionado con el nombre asturiano de la urraca (pega), como quizá también lo estén otros topónimos próximos, tales como El Pego (Gibraleón), Los Pegos (San Silvestre de Guzmán) o Las Pegas (Punta Umbría), y en la vecina provincia sevillana. De hecho, la abundancia de urracas es notable en toda la región. De ser cierta esta procedencia, el nombre podría ser producto de las influencias históricas del noroeste español sobre la parte occidental de Andalucía, causada por el repoblamiento posterior a la conquista cristiana y la inmediata ocupación de esta zona durante el siglo XIII.^[4]​ El nombre también puede ser un diminutivo de peguera, dado que existe en las proximidades (término de Punta Umbría) un lugar denominado La Peguera. Este término hace referencia a un lugar donde se quema leña de pino para obtener resinas o bien al lugar donde se prepara la pez para marcar al ganado en los procesos de esquilado, actividad que pudo estar relacionado con la ubicación del antiguo apeadero.

Sus coordenadas geográficas son: Latitud: 37°20'24" N (37.3362500°), Longitud: 6°57'0" W (-6.9484500°)^[5]​ y Altitud: 10 m s. n. m.

En las proximidades se encuentra el Caño de Peguerillas, uno de los brazos en que se divide el río Odiel antes de su llegada a Huelva.

Las principales actividades económicas de Peguerillas están ligadas a la presencia del polígono industrial: gasolinera, concesionarios de automóviles, talleres mecánicos, materiales para la construcción, fábricas de alimentos, multicentro comercial, etc. También existen algunas actividades ligadas a la agricultura, como pequeñas huertas y cultivos de fresas.