Pedro de Luna y Bobadilla, fue hijo de Álvaro de Luna y Ayala, II Señor de Fuentidueña, y de Isabel de Bobadilla y Maldonado, hija de Pedro de Bobadilla y María de Maldonado, y por tanto hermana de Francisco de Bobadilla, corregidor de Córdoba, y de Beatriz de Bobadilla, I marquesa de Moya.^[2]​

En 1506, se estableció una alianza entre la Casa de Luna y la Casa de Manrique mediante el matrimonio de Pedro y María, hijos del II Señor de Fuentidueña, con Aldonza y García, hijos del II conde de Osorno, capitulándose ambos matrimonios en una misma escritura.^[1]​

En 1520, comienza la Guerra de las Comunidades donde tanto Pedro de Luna y Bobadilla como el concejo de Fuentidueña estuvieron de parte del bando realista.^[3]​

Pedro de Luna y Bobadilla fue un caballero muy distraído en cuanto a la fidelidad del matrimonio, sus escándalos sexuales fueron tan grandes que el emperador Carlos V tuvo que ordenar una investigación que terminó con su prisión y el destierro de muchas personas. La mediación de su suegro, II conde Osorno, y de su hermano, Álvaro de Luna y Bobadilla, permitió su liberación y el retorno a Fuentidueña de todos los desterrados menos del portero de la fortaleza.^[1]​

En 1530, Francisco de Villamizar, vecino de Fuentidueña, le demandó el pago de 50.000 maravedíes correspondientes al tiempo que sirvió a don Pedro como mayordomo, maestresala y otros oficios, y además como compensación por los salarios que perdió al cesar en el oficio de alguacil que hasta entonces disfrutaba. Los historiadores consideran este pleito y otros similares como síntomas de una vida disipada.^[3]​

En el momento de su muerte, Pedro de Luna y Bobadilla era alcalde de la ciudad de Loja^[1]​, donde su familia poseía importantes intereses que su padre, Álvaro de Luna y Ayala, había adquirido por concesión real.^[4]​

Pedro de Luna y Bobadilla falleció el 26 de diciembre de 1542 y probablemente recibió sepultura en el convento de San Francisco de Fuentidueña.

Pedro de Luna y Bobadilla contrajo matrimonio con Aldonza Manrique, hija de Pedro Fernández Manrique y Vivero, II conde de Osorno, con la que tuvo varios hijos:^[1]​

1. Álvaro de Luna y Manrique, IV Señor de Fuentidueña, sin sucesión.^[3]​
2. Aldonza de Luna y Manrique, monja dominica en el convento de Aldeanueva de Santa Cruz (Ávila).^[3]​

Estando casado con Aldonza, tuvo varios hijos fuera del matrimonio a los que dejó herederos universales de todos sus bienes libres:^[1]​

1. Juan de Luna
2. Pedro de Luna

• Casa de Fuentidueña
• Señorío de Fuentidueña
• Condado de Fuentidueña
• Comunidad de Villa y Tierra de Fuentidueña

• López de Haro, Alonso (1622). Nobiliario genealógico de los reyes y títulos de España. Luis Sánchez. 

• Guarnido Olmedo, Victoriano (1972). «Repartimiento de Huétor-Tajar y su evolución posterior». Cuadernos geográficos de la Universidad de Granada (2). ISSN 0210-5462.  (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).

• Hernánsanz Navas, Justo (1985). Fuentidueña y su alfoz: notas histórico-arqueológicas. Autoedición. ISBN 978-84-398-4817-2. 

• Barrios Aguilera, Manuel (1986). Moriscos en la tierra de Loja: el apeo de 1571-1574: estudio y edición. Granada: Memoria de Licenciatura inédita. ISBN 84-398-6108-7. 

• Jiménez Estrella, Antonio (2007) “Linajes y alcaides en el Reino de Granada bajo los Austrias. ¿Servicio militar o fuentes de enriquecimiento y honores?”, en Francisco Andújar Castillo (ed.), Los nervios de la guerra. Estudios sociales sobre el Ejército de la Monarquía Hispánica (siglos XVI-XVIII): nuevas perspectivas, Editorial Comares, Granada, págs. 89-120.[1]

• Cuéllar Lázaro, Juan (2007). Fuentidueña: comunidad de villa y tierra. Alcobendas: Real del Catorce, S.L. ISBN 978-84-935572-4-9. 

• Comunidad de Villa y Tierra de Fuentidueña
• César Herrero Hernánsanz