El PSGE fue fundado en 1986 por exiliados ecuatoguineanos en España, liderados por Tomás Mecheba Fernández y Andrés Esono Ondó.^[1]​ De acuerdo al historiador Donato Ndongo-Bidyogo, la fundación del partido se produjo a partir de la gestión directa del Partido Socialista Obrero Español (PSOE).^[2]​

La formación inició su actividad política en Guinea Ecuatorial tras la instauración del multipartidismo en el país a comienzos de los años 90. Nacido como un partido claramente opositor al régimen de Teodoro Obiang Nguema, formó parte brevemente de la Plataforma de Oposición Conjunta (POC)^[3]​ y sugirió una intervención militar extranjera en el país para terminar con las violaciones a los derechos humanos por parte del gobierno de Obiang.^[4]​ Su primera participación electoral tuvo lugar en las elecciones legislativas de 1993, en las que obtuvo magros resultados. Mantuvo estrechas relaciones con el PSOE.^[5]​

No obstante, a partir de los años 2000 el PSGE abandonó su vocación opositora y adquirió una postura favorable al régimen de Obiang, integrándose a su gobierno con cargos menores.^[4]​ Tras presentarse a las elecciones legislativas de 2004 y obtener bajos resultados, el PSGE también pasó a presentarse junto a otras formaciones opositoras en coalición al gobernante Partido Democrático de Guinea Ecuatorial (PDGE) para elecciones legislativas y presidenciales.

En mayo de 2012, el líder del PSGE Tomás Mecheba Fernández fue nombrado Ministro de la Prevención y Lucha contra el VIH/SIDA y Enfermedades transmisibles sexualmente.^[4]​ En mayo de 2016, pasó a ocupar el cargo de Ministro de Turismo.^[6]​