Las primeras sospechas de contagio en el departamento se reportaron el 27 de febrero, cuando la Gerencia Regional de Salud (GERESA) Lambayeque anunció la identificación de un paciente (un menor de 5 años que regresó al país desde Corea del Sur) con síntomas sospechosos de COVID-19 en el Hospital Regional de Lambayeque.^[1]​ Más tarde, el 28 de febrero, la prueba del paciente resultó negativa según las declaraciones del Ministerio de Salud.^[2]​

Otros dos casos sospechosos fueron registrados el 5 de marzo, cuando un varón de 32 años viajó por un periodo vacacional a México, y a su regreso hizo escala en el El Salvador. Desde allí voló a Lima, para posteriormente dirigirse a Chiclayo, en donde presentó sintomatología de infección respiratoria. Una mujer de 44 años mantuvo contacto cercano con el varón, por lo que también fue monitoreada por precaución. Poco tiempo después fueron atendidos en el Hospital Luis Heysen de EsSalud, en donde se procedió a tomarles muestras para coronavirus.^[3]​ Dos días después, las pruebas de los dos pacientes, enviadas a Lima, resultaron negativas según informaron las autoridades del Instituto Nacional de Salud (INS).^[4]​

El 15 de marzo, en horas de la tarde, a través de su cuenta de Twitter, el MINSA confirma el primer caso de coronavirus en el departamento de Lambayeque, pero no se da más detalles al respecto.^[5]​ Ya en el atardecer, el Gerente Regional de Salud de Lambayeque, Jorge Ordemar Vásquez compartió mayor información sobre el caso confirmado. Se trataba de una mujer de 24 años que regresó de un viaje a España e Italia, quien arribó a Lima y desde allí se dirigió a Chiclayo. Ella presentó sintomatología relacionada con la enfermedad y fue inmediatamente aislada.^[6]​

Durante la primera semana de abril, empiezan a surgir problemas relacionados con la capacidad hospitalaria en el departamento. De forma rápida y agresiva los decesos por COVID-19 se duplicó en cuestión de un día en la región. Juan Ordemár Vásquez reportó que en su totalidad, los ventiladores mecánicos se encontraban ocupados, mientras el funcionario expresó que «Si la población lambayecana no cumple con el aislamiento social obligatorio no vamos a poder dar abasto a la población que viene complicada con la enfermedad. Estamos a punto de colapsa».^[7]​

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En septiembre, el coordinador regional de inmunizaciones de la GERESA, José Antonio Enríquez Salazar notificó que desde el comienzo del año se habían procesado un total de 21 141 pruebas de diagnóstico para COVID-19, detectándose la enfermedad en 964 personas y falleciendo otras 25.^[13]​

Al cierre del año, la región norteña registró un total de 54 muertos por COVID-19.^[14]​

José Enríquez informó que durante la primera semana epidemiológica del año, 803 personas fueron sometidas a test de COVID-19, encontrando a 143 positivos a la afección.^[14]​

El 26 de enero de 2021, debido al resurgimiento de una segunda ola y una mayor incidencia en la violación de la cuarentena, el gobierno vuelve a establecer una serie de medidas para contener el avance del COVID-19 en el país. Según las nuevas medidas adoptadas, los departamentos del país serían clasificados por niveles de riesgo según la cantidad de contagios que se registren. El departamento de Lambayeque fue considerado en nivel alto, y las medidas tendrían vigencia a partir del 31 de enero hasta el 14 de febrero.^[15]​

El 11 de febrero, el gobierno anunció una ampliación de la cuarentena, basándose en una reforma del sistema en el que ha decidido implementar medidas a nivel provincial. En el departamento de Lambayeque, se eleva al nivel muy alto, siendo todas las provincias de este departamento afectadas bajo este nivel de riesgo. Esta ampliación implica que la fecha límite de aplicación ya no sea el 14 de febrero, sino, el 28 de febrero. Las medidas incluían;^[16]​

• Inmovilización social obligatoria desde el 15 de febrero.
• Los centros de abastecimiento solo podrán operar hasta las 18:00 UTC-5.
• Prohibición de consumo en restaurantes (permisión de servicio a delivery).
• Suspensión de celebraciones, tales como: festivales, fiestas patronales, actividades civiles o reuniones de toda índole.
• El tránsito de vehículos particulares sigue siendo limitado, con excepción de motivos laborales sacanado un pase de tránsito.

2020: Cierre nacional

La pérdida de clases ocasionada por la postergación obligó al ministerio a plantear la educación a distancia creando el programa «Aprendo en casa» para la recuperación de clases^[18]​ Dada las dificultades derivadas de la falta de cobertura de medios de comunicación y el dominio del quechua, en zonas rurales como los distritos de Incahuasi y Cañaris, el acceso a la educación a distancia sigue siendo un impedimento para el aprendizaje de alrededor de 3 mil menores en la zona altoandina del departamento.^[19]​ Daniel Suárez Becerra, Gerente Regional de Educación de Lambayeque, informó a La República que a finales de 2020, 22 mil 064 estudiantes no tenían acceso a la educación remota en el departamento.^[20]​

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2021: Reapertura progresiva

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2022: Retorno absoluto

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Tras la restricciones de libre circulación que implementó el gobierno del Perú en diversos departamentos del país (incluido Lambayeque) para contener la propagación del COVID-19 en el territorio, muchas actividades de carácter religioso tuvieron que ser canceladas por completo o trasladas a otras fechas. Desde entonces, muchas iglesias y parroquias han decidido oficiar misas o realizar celebraciones religiosas de manera virtual para evitar la congregación de personas o las multitudes que acudían a estas festividades.

El 5 de julio de 2020, las autoridades locales de Motupe, informaron mediante un comunicado que la festividad de la Santísima Cruz de Motupe (festividad local de carácter de peregrinación religiosa) sería llevada a cabo de forma virtual y no presencialmente, como era usual cada año. En reemplazo, anunciaron que se celebraría de manera virtual, para evitar la aglomeración de los peregrinos.^[38]​

En una entrevista de RPP a Carlos Burgos Montenegro, Presidente de la Cámara de Comercio y Producción de Lambayeque, aseguró que cerca de 90 mil personas habrían perdido su empleo como consecuencia de la emergencia sanitaria por la pandemia de COVID-19 en el departamento. Burgos señaló que tras esta situación, muchos desempleados tuvieron que reinvertarse dando inició a nuevos negocios en distintos rubros.^[39]​

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