PROSITE es una base de datos de familias y dominios de proteínas creada por Amos Bairoch en 1988.[1][2] Consiste en entradas que describen dominios, familias y sitios funcionales así como patrones de aminoácidos. Estos son manualmente verificados por un equipo del Instituto Suizo de Bioinformática e integrado con la base de datos de Swiss-Prot.
PROSITE | ||
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Información general | ||
Dominio | http://prosite.expasy.org/ | |
Tipo |
Base de datos biológica Base de datos en línea | |
Idiomas disponibles | Inglés | |
En español | No | |
Gestión | ||
Desarrollador | Amos Bairoch | |
Sus usos incluyen la identificación de posibles funciones de las proteínas recientemente descubiertas y el análisis de aquellas ya conocidas pero con actividades previamente desconocidas. PROSITE ofrece herramientas para el análisis de secuencias de proteínas y detección de motivos de proteínas; es parte de los servidores de análisis de proteómica de ExPASy.
La base de datos ProRule se basa en las descripciones de dominio de PROSITE.[3] Esta proporciona información adicional acerca de funcionalidades o de aminoácidos estructuralmente críticos. Las reglas contienen información sobre los residuos biológicamente significativos, como sitios activos, sitios de unión a sustrato o cofactores, modificaciones postraduccionales o enlaces disulfuro, para ayudar a determinar la función. Estas pueden automáticamente generar anotaciones basados en los motivos de PROSITE.