En el año 2013, Shio Ogura es una estudiante de instituto japonesa que visita Taiwán en un viaje escolar. De pronto, Kaohsiung, la ciudad donde se encuentran, es atacada por monstruos llamados "Objetos Invasores Evolucionarios" (進化侵略体, "Objetos Invasores Evolucionarios"^?), incapaces de ser derrotados por el ejército convencional. Aparecen unos agentes conocidos como los "Portadores del Gen E" (E遺伝子ホルダー, "Portadores del Gen E"^?) pertenecientes a la agencia gubernamental DOGOO, que empuñan armas infundidas con los espíritus de personajes históricos. Shio descubre que ella también es una Portadora del Gen E cuando el alma de Oda Nobunaga despierta dentro de ella al intentar rescatar a una amiga.

Shio Ogura (小椋しお, Ogura Shio^?)

Seiyū: Shiori Mutō^[1]​

Una estudiante de Japón que atiende a un instituto femenino. Es una portadora del Gen E de Oda Nobunaga. Es bastante torpe y un poco despistada, por lo que la mayoría de sus compañeras de clase, a excepción de Asao, evitan acercarse a ella. Tiene una fascinación por el equipamiento militar, aunque trata de esconderlo para que sus compañeras no piensen que es rara. Se une a DOGOO tras el incidente de Kaohsiung.

Nobunagun (Oda Nobunaga) (ノブナガン（織田信長）, Nobunagan (Oda Nobunaga)^?)

Seiyū: Nobuo Tobita^[2]​

Adam Muirhead/Jack el Destripador (アダム・ミューアヘッド/切り裂きジャック, Adamu Mūaheddo/Kirisaki Jakku^?)

Seiyū: Tatsuhisa Suzuki^[3]​

Mahesh Mirza/Mahatma Gandhi (マヘシュ・ミルザ/マハトマ・ガンジー, Maheshu Miruza/Mahatoma Ganjii^?)

Seiyū: Nobunaga Shimazaki^[4]​

Jess Beckham/Isaac Newton (ジェス・ベッカム/アイザック・ニュートン, Jesu Bekkamu/Aizakku Nūton^?)

Seiyū: Yū Asakawa^[5]​

Comandante (壱与, Iyo^?)

Seiyū: Ai Sato

DOGOO (土偶, Dogō^?)

Seiyū: Akeno Watanabe

St. Germain (サンジェルマン, Sanjeruman^?)

Seiyū: Kōji Yusa

François Vidocq (ヴィドック, Vidokku^?)

Seiyū: Akira Ishida

Galiko/Galileo Galilei (ガリ子, Gariko^?)

Seiyū: Sumire Uesaka

Kaoru Asao (浅尾 かおる, Asao Kaoru^?)

Seiyū: Haruno Inoue

Geronimo

Seiyū: Chiwa Saitō

Ibukigīn Erdenbileg/Cyx (イブキギーン・エルデネビルグ, Ibukigīn Erudenebirugu^?)

Seiyū: Mutsumi Tamura

Antoni Gaudi (アントニ・ガウデ, Antoni Gaudi^?)

Seiyū: Ayumu Murase

Hunter/John Hunter (ハンター, Hantā^?)

Seiyū: Makoto Yasumura

Annus/Robert Capa (アヌシュ, Anushu^?)

Seiyū: Kenjirō Tsuda

Dai Zong

Seiyū: Kenta Matsumoto

Maria Williams

Seiyū: Kyōko Narumi

Gonda

Seiyū: Shōto Kashii

Madre de Shio

Seiyū: Yō Taichi

Harold S. Conway

Seiyū: Yoshihisa Kawahara

Una adaptación en formato anime producida por Bridge empezó su emisión el 5 de enero de 2014.^[6]​ El tema de inicio es "Respect for the dead man" por Pay money To my Pain.

• Nobunagun (en japonés)
• Nobunagun (anime) en la enciclopedia Anime News Network (en inglés)