NAMD (Not (just) Another Molecular Dynamics program)[1] es un software para dinámica molecular en paralelo diseñado para simulaciones de alto desempeño de sistemas biomoleculares. Se hizo acreedor de un premio Gordon Bell en 2002.[2] Está basado en objetos paralelos Charm++ y es escalable a cientos de procesadores en plataformas de punta y decenas de procesadores en cómodos clusters usando ethernet gigabit. NAMD usa el popular programa de presentación gráfica molecular VMD para configurar la simulación y analizar las trayectorias, siendo también parcialmente compatible con AMBER, CHARMM y X-PLOR.
NAMD | ||
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Información general | ||
Tipo de programa | Dinámica molecular | |
Desarrollador | Theoretical and Computational Biophysics Group (TCB) y The Parallel Programming Laboratory (PPL) | |
Licencia | University of Illinois license | |
Estado actual | Con soporte | |
Idiomas | 1 | |
Información técnica | ||
Programado en | C++ | |
Plataformas admitidas | «x86», «x86-64» | |
Versiones | ||
Última versión estable | 2.9 (info) ( 30 de abril de 2012 (12 años, 9 meses y 1 día)) | |
Enlaces | ||
[1]
Repositorio de código
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