El museo fue creado el 17 de febrero de 1970 como Museo de Arte e Historia gracias al impulso del reconocido historiador de arte, el Dr. Francisco Stastny Mosberg y durante la rectoria del maestro Juan De Dios Guevara.^[1]​ Su finalidad era que, dentro de la misma casa de estudios, funcionara una institución encargada de reunir, conservar, estudiar y exhibir el patrimonio histórico y artístico de la Universidad de San Marcos. En el año 1996, se cambió su denominación por la de Museo de Arte de San Marcos (siglas: MASM), incorporando en sus fondos importantes creaciones artísticas de diferentes épocas de la historia del arte peruano.

Actualmente cuenta con cuatro importantes colecciones: de retratos, de arte popular, de arte moderno y contemporáneo, y del archivo de dibujo y pintura campesina.

La colección incluye retratos de varios sanmarquinos e hispanoamericanos ilustres, algunos de los cuales se pueden observar a continuación:

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  Cipriano de Medina y Vega, catedrático sanmarquino y obispo de Huamanga.
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  Fray José de Peralta Barnuevo y Rocha Benavides, catedrático sanmarquino y obispo de Buenos Aires y La Paz.
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  Francisco Gutiérrez Galeano, obispo de Huamanga.
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  Diego Montero del Águila, catedrático sanmarquino y Obispo de Concepción (Chile) y Trujillo (Perú).
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  José Baquíjano y Carrillo, conde de Vista Florida.
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  José Hipólito Unanue y Pavón, médico, naturalista, catedrático sanmarquino, precursor peruano de la independencia.
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  Jerónimo López Guarnido, abogado y rector sanmarquino.
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  Vicente Morales Duárez, jurista, catedrático sanmarquino y presidente de las Cortes de Cádiz.
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  Fray Nicolás de Ulloa, obispo de Córdoba del Tucumán.
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  Pedro José Bravo de Lagunas, catedrático sanmarquino.
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  Francisco Ruiz Lozano, Cosmógrafo Mayor del Perú.
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  Sebastián Lorente, maestro sanmarquino.
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  Fray Tomás de San Martín, gestor de la fundación de la Universidad de San Marcos.

Colección de arte popular de la universidad, proveniente del fondo de las hermanas Celia y Alicia Bustamante y de la peña Pancho Fierro.

Su colección de arte moderno y contemporáneo, la cual comprende los siglos XX y XXI, es considerada por diversos especialistas como la más completa en el medio peruano.

Colección del archivo de dibujo y pintura campesina de la universidad, incorporado en 2004 al museo, proveniente de los diez concursos de pintura campesina que se realizaron entre 1984 y 1996.

• Museo
• Universidad Nacional Mayor de San Marcos

1. ↑ Quevedo Ganoza, Fernando (1° de marzo del 2010). «Centenario del nacimiento del Maestro Juan de Dios Guevara». Rev Soc Quím Perú. 76 (1) 2010. Consultado el 23 de febrero de 2025. 

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• Página oficial del Museo de Arte de la UNMSM Archivado el 15 de junio de 2012 en Wayback Machine.
• Facebook oficial del Museo de Arte de la UNMSM
• Visita Lima (Municipalidad Metropolitana de Lima): Museo de Arte de la UNMSM (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
• Página oficial de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos