Nació en 1991, pero se constituyó como asociación en 1993. Surgió como respuesta al incremento de los discursos racistas y xenófobos, materializados en crímenes de odio contra jóvenes inmigrantes en España.^[1]​

En 2011 lanzaron la campaña juvenil «Rap contra el racismo», apoyada por el Injuve, que incluyó la producción de un álbum en el que participaron los raperos El Chojin, Locus y Nerviozzo de Dúo Kie, Gitano Antón y El Langui de La Excepción, Nach, Lírico, Kase.O y Sho-Hai de Violadores del Verso, Xhelazz, Titó y El Santo de Falsalarma, Zatu de SFDK y Ose.^[2]​

Los objetivos de la asociación son:^[3]​

• Promover en el ámbito de la educación, cultural y comunicación, los valores de solidaridad y tolerancia.
• Desarrollar iniciativas que dinamicen a los jóvenes y estimulen la creación de asociaciones de base para el desarrollo de intervenciones antirracistas, antixenófobas y antiviolentas.
• Promover, en el conjunto de la sociedad, una conciencia antidiscriminatoria y los valores de solidaridad e igualdad.

Además de recursos y materiales didácticos, el Movimiento Contra la Intolerancia publica anualmente el Informe Raxen, donde recopilan datos sobre discriminación y los casos que monitorizan.^[1]​