• La iglesia es de una nave central y otra lateral que es la capilla del Cristo de la Columna, de Francisco Salzillo.^[3]​ El coro está situado sobre la puerta de la entrada y el crucero está separado del resto de la nave por una pequeña reja y un Cristo Crucificado, denominado Cristo de la Reja del siglo XVII, de gran devoción entre la población de Jumilla. El crucero está flanqueado por dos magníficos relicarios del año 1613, que contienen reliquias traídas por el Marqués de Villena, a principios del siglo XVII, desde Italia. El retablo del altar mayor, está presidido por una imagen de Santa Ana, del siglo XV.
• Capilla del Cristo de la Columna. Podemos admirar en ella la talla del Cristo de la Columna, realizada por Salzillo en madera de ciprés. Es una obra muy querida y admirada por los fieles y la única que se traslada fuera del convento en romería.
• Museo. Contiene diferentes obras de arte y numerosas donaciones, muchas de ellas curiosas e interesantes.
• Dentro del huerto se encuentra la ermita de la Santísima Trinidad, de planta circular, con tres puertas, tres ventanas y tres altares, donde se pueden decir tres misas simultáneamente.

En cuanto al exterior, en el cuerpo central de la fachada hay dos torres similares de ladrillo, y en la parte superior hay una imagen de la titular del templo.

El atrio exterior se encuentra rodeado de los pasos necesarios para rezar un “via crucis”, los cuales están hechos con azulejería valenciana. El monasterio se encuentra cercado, y para acceder a la iglesia se atraviesa un patio con magníficas vistas, árboles y bancos para descansar.