Debutó con los Rojinegros del Atlas en 1996, logrando destacarse como uno de los mejores atacantes en el fútbol mexicano y siendo parte de una de las camadas más interesantes que ha tenido el equipo en su historia, jugadores de la talla de Juan Pablo Rodríguez, Daniel Osorno, Mario Méndez, Marco Ballesteros, Fernando Salazar, Erubey Cabuto, y el referente internacional mexicano, Rafael Márquez Álvarez, surgieron en la misma generación y fueron dirigidos por el argentino Ricardo La Volpe. Lograron llevar al Atlas a disputar la final del Verano 1999, que perdieron en tanda de penales ante el Toluca, luego empatar 5-5 en el marcador global (Estadio Jalisco 3-3 y Estadio Nemesio Díez 2-2)

Debido a sus grandes actuaciones con el conjunto atlista, Zepeda fue transferido al Cruz Azul; la expectación era mucha, sin embargo Zepeda nunca pudo tener el mismo rendimiento con el equipo cementero, por lo cual salió del club; a partir de ahí, Zepeda pasó por varios equipos del fútbol nacional, entre ellos, el Morelia, Toluca, Club Santos Laguna, Club América, San Luis FC y los Tiburones Rojos de Veracruz, pero en ninguno tuvo la suerte ni el éxito que había logrado con el Atlas a inicios de su carrera.^[2]​

Después de dos años de inactividad, Zepeda regresó al Atlas para el Apertura 2009, recuperando poco a poco su nivel y en el Bicentenario 2010 tuvo un inicio impresionante anotando 7 goles en 8 partidos, sin embargo el conjunto atlista lo dio de baja debido a cuestiones de indisciplina como las que tuvo durante toda su carrera.

De cara al Apertura 2010 fue fichado por los Leones Negros de la Liga de Ascenso de México, jugando pocos minutos.

La siguiente tabla detalla los encuentros disputados y los goles marcados en los clubes en los que militó.

Bajo la dirección técnica de Manuel Lapuente, debutó con la Selección mayor de México el 10 de febrero de 1999, en un partido amistoso ante Argentina.

Formó parte de los planteles de la Selección de México que asistieron a la Copa Carlsberg 1999 y 2000, Copa USA 1999, Copa Corea 1999, Copa Confederaciones 1999, Copa América 1999 y 2001 y a la Copa de Oro de la Concacaf 2003; además de disputar varios encuentros de la Clasificación de Concacaf para la Copa Mundial de Fútbol de 2002.

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