Hay tres especies en este género:^[1]​

• Microgenys lativirgata N. E. Pearson, 1927
• Microgenys minuta C. H. Eigenmann, 1913
• Microgenys weyrauchi Fowler, 1945

• Eschmeyer, William N.: Genera of Recent Fishes. California Academy of Sciences. San Francisco, California, Estados Unidos. iii + 697. ISBN 0-940228-23-8. Año 1990.
• Eschmeyer, William N., ed. 1998. Catalog of Fishes. Special Publication of the Center for Biodiversity Research and Information, núm. 1, vol. 1-3. California Academy of Sciences. San Francisco, California, Estados Unidos. 2905. ISBN 0-940228-47-5.
• Helfman, G., B. Collette i D. Facey: The diversity of fishes: Biology, Evolution, and Ecology. Blackwell Science, Malden, Massachusetts, Estados Unidos, 1997. ISBN 1405124946.
• Moyle, P. i J. Cech.: Fishes: An Introduction to Ichthyology, 4ª edición, Upper Saddle River, Nueva Jersey, Estados Unidos: Prentice-Hall. Año 2000. ISBN 0130112828.

• Microgenys en Catalogue of Life (en inglés)
• Microgenys en Encyclopedia of Life (en inglés)
• Microgenys en World Register of Marine Species (en inglés)