Micobiota (sustantivo plural, no singular) es un grupo de todos los hongos presentes en una región geográfica particular (por ejemplo, "la micobiota de Irlanda ") o tipo de hábitat (por ejemplo, "la micobiota del cacao").[1][2]
La micobiota existe en la superficie y en el sistema gastrointestinal de los humanos.[3] Hay hasta sesenta y seis géneros y 184 especies en el tracto gastrointestinal de personas sanas. La mayoría de estos están en los géneros de Candida.[4][5]
Aunque se encontró que está presente en la piel y en el tracto gastrointestinal en individuos sanos, la micobiota residente normal puede volverse patógena en aquellos que están inmunocomprometidos.[6][7] Tales infecciones multiespecies conducen a una mayor mortalidad.[8]
Además, las infecciones adquiridas en el hospital por C. albicans se han convertido en una causa de importantes problemas de salud.[9] Una alta tasa de mortalidad del 40-60% se asocia con infección sistémica.[10][11][12][13][14][5] Los mejor estudiados son las especies de Candida debido a su capacidad de convertirse en patógenos en inmunocomprometidos e incluso en hospedadores sanos. Las levaduras también están presentes en la piel, como las especies de Malassezia, donde consumen aceites secretados por las glándulas sebáceas.[15][16] Pityrosporum (Malassezia) ovale, que depende de los lípidos y se encuentra solo en humanos. P. ovale luego se dividió en dos especies, P. ovale y P. orbiculare, pero las fuentes actuales consideran que estos términos se refieren a una sola especie de hongo, con M. furfur como nombre preferido.