Contiene las siguientes especies:^[2]​

• Mercenaria campechiensis (Gmelin, 1791)
• Mercenaria mercenaria (Linnaeus, 1758)
• Mercenaria stimpsoni (Gould, 1861)
• Mercenaria texana (Dall, 1902)

Algunas otras especies solo se conocen a partir de fósiles. Estos moluscos vivieron del Oligoceno al Cuaternario (de 23,03 a 0,0 Ma). Se han encontrado conchas fósiles en sedimentos de Rusia, Japón, Indonesia, Estados Unidos y Brasil.^[3]​

• † Mercenaria plena inflata Dall, 1903
• † Mercenaria plena nucea Dall, 1903
• †Mercenaria blakei Ward, 1992
• †Mercenaria campechiensis carolinensis Conrad, 1875
• †Mercenaria campechiensis rileyi Conrad, 1838
• †Mercenaria campechiensis tridacnoides Lamarck, 1818
• †Mercenaria capax Conrad, 1843
• †Mercenaria cuneata Conrad, 1869
• †Mercenaria druidi Ward, 1992
• †Mercenaria ducatelli Conrad, 1838
• †Mercenaria erecta Kellum, 1926
• †Mercenaria gardnerae Kellum, 1926
• †Mercenaria langdoni Dall, 1900
• †Mercenaria nannodes Gardner, 1947
• †Mercenaria permagna Conrad, 1838
• †Mercenaria plena Conrad, 1869
• †Mercenaria prodroma Gardner, 1947
• †Mercenaria tetrica Conrad, 1838

• W. S. Arnold, T. M. Bert, D. C. Marelli, H. Cruz-Lopez, P. A. Gill Genotype-specific growth of hard clams (genus Mercenaria) in a hybrid zone: variation among habitats
• John Norman Kraeuter, Michael Castagna Biology of the Hard Clam