Clasificar la familia Marginellidae ha sido durante mucho tiempo confuso. Muchas obras populares todavía tratan a todos los miembros de esta familia bajo el único género Marginella, basándose mayormente en las características superficiales del caparazón.

Aunque existen muy buenos caracteres diferenciales dentro de este grupo, estos generalmente fueron malinterpretados o no reconocidos como significativos. La información que existía sobre las rádulas y la anatomía externa de los animales vivos estaba muy dispersa en la literatura científica, y las descripciones anatómicas internas no estuvieron disponibles hasta hace relativamente poco tiempo.

En 2019, se estableció una nueva filogenia molecular de gasterópodos margineliformes por Fedosov AE, Caballer Gutierrez M., Buge B., Sorokin PV, Puillandre N., Bouchet P. ^[1]​

El caparazón de las marginellas suele ser pequeño, pero varía en diferentes especies. El color externo del caparazón puede ser blanco, crema, amarillo, naranja, rojo o marrón, aunque puede tener un color uniforme o patrón. La protoconcha es paucispiral. El labio del caparazón está engrosado y puede ser liso o denticulado. Puede haber una variz externa o no, y una muesca sifonal puede estar presente o no. La columela puede poseer de 2 a 6 plicaturas. No se encuentra opérculo en esta familia.

• Subfamilia Austroginellinae GA Coovert y HK Coovert, 1995

• Alaginella Laserón, 1957
• Austroginella Laserón, 1957
• Caribeginella Espinosa & Ortea, 1998
• Hidroginella Laserón, 1957
• Marigordiella Espinosa & Ortea, 2010
• Mesoginella Laserón, 1957
• Ovaginella Laserón, 1957
• Protoginella Laserón, 1957
• Serrata Jousseaume, 1875

• Subfamilia Marginellinae Fleming, 1828

• Dentimargo Cossmann, 1899
• Eratoidea Weinkauff, 1879
• Gibbacousteau Espinosa y Ortea, 2013
• Glabela Swainson, 1840
• Marginella Lamarck, 1799
• Nudifaba Eames, 1952 †
• Stazzania Sacco, 1890 †

• Subfamilia Pruninae GA Coovert y HK Coovert, 1995

• Balanetta Jousseaume, 1875
• Bullata Jousseaume, 1875
• Closia Gris, 1857
• Criptospira Hinds, 1844
• Hyalina Schumacher, 1817
• Mirpurina Ortea, Moro & Espinosa, 2019
• Prunum Herrmannsen, 1852
• Rivomarginella Brandt, 1968
• Volvarina Hinds, 1844

Subfamilia Incertae sedis

• Demissa Boyer, 2016

• Granulininae GA Coovert & HK Coovert, 1995 : sinónimo de Granulinidae GA Coovert & HK Coovert, 1995 (rango original)
• Marginelloninae Coan, 1965: sinónimo de Marginellonidae Coan, 1965 (rango original)
• Carinaginella Laseron, 1957 : sinónimo de Alaginella Laseron, 1957
• Cassoginella Laseron, 1957 †: sinónimo de Alaginella Laseron, 1957
• Deviginella Laseron, 1957 : sinónimo de Mesoginella Laseron, 1957
• Haloginella Laseron, 1957 : sinónimo de Serrata Jousseaume, 1875
• Neptoginella Laseron, 1957 : sinónimo de Hydroginella Laseron, 1957
• Pillarginella Gabriel, 1962: sinónimo de Hydroginella Laseron, 1957
• Plicaginella Laseron, 1957 : sinónimo de Austroginella Laseron, 1957
• Serrataginella GA Coovert & HK Coovert, 1995 : sinónimo de Serrata Jousseaume, 1875
• Sinuginella Laseron, 1957 : sinónimo de Mesoginella Laseron, 1957
• Spiroginella Laseron, 1957 : sinónimo de Mesoginella Laseron, 1957
• Triginella Laseron, 1957 : sinónimo de Alaginella Laseron, 1957
• Cucumis "Klein": sinónimo de Marginella Lamarck, 1799 (nombre no disponible)
• Faba P. Fischer, 1883 : sinónimo de Glabella Swainson, 1840 (sinónimo objetivo de Glabella)
• Longinella Laseron, 1957 : sinónimo de Dentimargo Cossmann, 1899 (preocupado por Longinella Gros & Lestage, 1927 [Ephemeroptera])
• Marginellarius Duméril, 1805 : sinónimo de Marginella Lamarck, 1799
• Marginellus Montfort, 1810 : sinónimo de Marginella Lamarck, 1799 (enmienda injustificada de Marginella)
• Porcellana Gray, 1847 : sinónimo de Marginella Lamarck, 1799 (inválido: homónimo menor de Porcellana Lamarck, 1801 [Crustacea])
• Pseudomarginella Maltzan, 1880 : sinónimo de Marginella Lamarck, 1799
• Volvarinella Habe, 1951 : sinónimo de Dentimargo Cossmann, 1899
• Egouana : sinónimo de Egouena Jousseaume, 1875 : sinónimo de Prunum Herrmannsen, 1852 (no válido: ortografía original alternativa incorrecta)
• Egouena Jousseaume, 1875 : sinónimo de Prunum Herrmannsen, 1852
• Gibberulina Monterosato, 1884 : sinónimo de Bullata Jousseaume, 1875
• Leptegouana Woodring, 1928 : sinónimo de Prunum Herrmannsen, 1852
• Porcellanella Conrad, 1863 †: sinónimo de Prunum Herrmannsen, 1852 (inválido: homónimo menor de Porcellanella White, 1852 [Crustacea]. )
• Volutella Swainson, 1831 : sinónimo de Bullata Jousseaume, 1875 (no válido: homónimo menor de Volutella Perry, 1810 [Vasidae])

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