Nació en Lima en 1950, pero su niñez la vivió en Piura, ciudad ubicada en el norte peruano, de donde provenía su familia. A los 9 años se traslada a Lima, donde estudia en el colegio del Sagrado Corazón hasta los 15 años, cuando sus padres deciden llevarla a estudiar a un internado en Londres.

A su regreso a Lima, luego de tres años vacilaciones y sin contar con el apoyo paterno, decide estudiar arte en la Pontificia Universidad Católica del Perú. Posteriormente, en la década del noventa, se traslada a Costa Rica junto a su esposo, huyendo del conflicto armado interno desatado por Sendero Luminoso.^[1]​

Retorna al Perú en 1996. Decide establecerse en la ciudad de Lima, capital del Perú, y construye su taller en Villa el Salvador. El siguiente año, en 1997, viaja por primera vez a Pucallpa (Ucayali) en busca de madera, en su viaje Checa constata la depredación de los bosques y este hecho la introduce en las preocupaciones ambientales.^[2]​

En 2001 es entrevistada en un programa neoyorkino por el periodista Larry Davidson y esta entrevista obtiene un premio entre las mejores del año, resaltando así su trayectoria como escultora.^[2]​

En 2013 promueve un importante evento en Perú que contó con la presencia de John D. Liu, cineasta y ecologista chino-estadounidense, para contribuir con propuestas y acciones relacionadas con la situación de la Amazonía.^[2]​

Cursó sus primeros estudios entre 1972 y 1980 en la Facultad de Arte de la Pontificia Universidad Católica del Perú, graduándose con honores. Entre sus maestros estuvieron la escultora italiana radicada en Lima Anna Maccagno^[3]​ y Adolfo Winternitz. Simultáneamente, entre 1975 y 1980, estudió en el taller de dibujo de la escultora Cristina Gálvez. Entre 1984 y 1985 estudió bajo la dirección del pintor peruano Leslie Lee Crosby.

A decir del crítico de arte peruano Carlos Rodríguez Saavedra, la obra de Margarita Checa es resultado de la confluencia entre la innovación y la tradición. En sus esculturas plasma su visión y concepto del mundo, así como sus vivencias, lo cual hace que su obra adquiera una gran carga expresiva.^[4]​

Además, en sus obras, la representación del cuerpo humano es reiterada, lo cual la ubica dentro del amplio espectro de artistas que exploran las posibilidades expresivas de la figura humana y que en el caso particular de la plástica peruana cuenta con exponentes de la talla de Cristina Gálvez, Marina Núñez del Prado y Johanna Hamann, cada una dentro de sus propios registros.^[5]​^{[Nota 1]}​

Ha trabajado en diversos materiales como la cera y el bronce. Sin embargo, es reconocida por su maestría en el trabajo con la madera, la cual emplea en esculturas de gran formato.^[6]​ Según la propia artista, este soporte —en especial el olivo— es un 5 elemento fundamental en su proceso creativo y en el entramado simbólico de su obra.^{[Nota 2]}​

Su acercamiento a las artes gráficas viene de su aprendizaje en el taller dirigido por Víctor Femenias junto a los grabadores Alberto Agapito y Jorge Ara. Bajo su enseñanza aprendió las técnicas de la punta seca, la litografía y el aguafuerte. Ha participado en los Salones Anuales de Grabado organizados por Instituto Cultural Peruano Norteamericano (ICPNA) entre los años de 1972 y 1974.^[7]​

Tuvo a su cargo el Taller de Dibujo y Escultura de la Pontificia Universidad Católica del Perú entre 1988 y 1989. Además fue Directora del Taller de Dibujo y Escultura de la escultora Cristina Gálvez entre 1982 y 1992, y ejerció la docencia en la Escuela de Arte y Diseño Corriente Alterna en Lima.

Desde 1977 la artista ha expuesto en diversas ciudades como Lima, Atlanta, Madrid y San José de Costa Rica, donde además residió entre 1993 y 1995.

En año 2013, el Instituto Cultural Peruano Norteamericano en Lima realizó una muestra antológica de sus 30 años de trayectoria artística.

• 1977, Galería Enrique Camino Brent. Lima, Perú.
• 1979, Galería Enrique Camino Brent. Lima, Perú.
• 1981, Galería Enrique Camino Brent. Lima, Perú.
• 1984, Galería Enrique Camino Brent. Lima, Perú.
• 1985, Taller Cristina Gálvez. Lima, Perú.
• 1985, Galería Macarrón. Madrid, España.
• 1989, Galería de la Municipalidad de Miraflores. Lima, Perú.
• 1991, Galería Enrique Camino Brent. Lima, Perú.
• 1996, Corriente Alterna. Lima, Perú.
• 1996, Galería de la Municipalidad de Miraflores. Lima, Perú.
• 1996, Lowe Gallery. Atlanta, Estados Unidos.
• 1997, Unveiling of Gea. Knoxville, Tennessee, Estados Unidos.
• 1998, Lowe Gallery. Atlanta, Estados Unidos.
• 1998, Galería Lucía de la Puente. Lima, Perú.
• 2000, Galería Arte Consult. Panamá, Panamá.
• 2000, Lowe Gallery. Atlanta, Estados Unidos.
• 2000, Galería Lucía de la Puente. Lima, Perú.^[4]​
• 2013, Galería Germán Krüger Espantoso. Lima, Perú.

• 1972, 30.º aniversario de la Pontificia Universidad Católica del Perú. Lima, Perú.
• 1975, Países no alineados. Conferencia Ministerial. Hotel Crillón. Lima, Perú.
• 1977, Jóvenes Artistas. Galería Fórum. Lima, Perú.
• 1979, Escultura Contemporánea. Galería 9. Lima, Perú.
• 1979, 40 Aniversario de la Pontificia Universidad Católica. Lima, Perú.
• 1979, 9 Dibujantes Peruanos, Galería 9. Lima, Perú.
• 1981, 100 Años de Escultura en el Perú. Museo de Arte de Lima. Lima, Perú.
• 1982, Homenaje a Cristina Gálvez. Centro Cultural Petroperú. Lima, Perú.
• 1983, Primera Bienal. Trujillo, Perú.
• 1985, Segunda Bienal. Trujillo, Perú.
• 1985, Homenaje a Anna Maccagno. Sala Luis Miró Quesada Garland de la Municipalidad de Miraflores. Lima, Perú.
• 1986, Dibujo sobre tela. Galería Fórum. Lima, Perú.
• 1987, 5 Escultoras en Grabado. Galería El Taller. Lima, Perú.
• 1987, Arte Erótico. La Estación, Barranco. Lima, Perú.
• 1990, Desnudo. La Galería. Lima, Perú.
• 1991, Dibujo sobre tela. Galería Fórum. Lima, Perú.
• 1991, Poetisas y Artistas. Galería de la Municipalidad de Miraflores. Lima, Perú.
• 1991, Poetisas y Artistas. Galería del Banco de Crédito. Lima, Perú.
• 1992, Corriente Alterna. Lima, Perú.
• 1992, La Galería. Lima, Perú.
• 1993, Galería Arte Consult. Panamá, Panamá.
• 1993, Exhibición Itinerante en el Perú, República Dominicana y México.
• 1993, La Madera. Museo del banco Wiese. Lima, Perú.
• 1994, Museo de Jade. San José, Costa Rica.
• 1995, Primera Bienal de Madera. Alajuela, Costa Rica.
• 1995, Tres Mujeres. San José, Costa Rica.
• 1996, Museo Pedro de Osma. Lima, Perú.
• 1997, Primera Bienal de Lima. Lima, Perú.
• 1997, Noche de Arte. Museo de Arte. Lima, Perú.
• 1998, Galería del Banco de Comercio. Lima, Perú.
• 2000, Tensiones Generacionales. Galería Germán Krüger Espantoso. Lima, Perú.
• 2000, V Aniversario. Galería Lucía de la Puente. Lima, Perú.
• 2000, Galería Arte Consult. Panamá, Panamá.^[4]​
• 2001, El Libro del Artista. Galería de Arte Petro Perú. Lima, Perú.
• 2002, Homenaje a Anna Maccagno. Museo Italiano. Lima, Perú.
• 2002, Arte latinoamericano. Galería Lucía de la Puente. Lima, Perú.
• 2003, Inauguración Galería Lowe. Santa Mónica, California, Estados Unidos.
• 2004, Aniversario Galería Lowe. Atlanta, Estados Unidos.
• 2004, Museo de Arte Latinoamericano. MOLAA. Los Ángeles, California, Estados Unidos.
• 2004, Tensiones Generacionales. Galería Germán Krüger Espantoso. Lima, Perú.
• 2004, Galería Lucía de la Puente. Lima, Perú.
• 2005, Feria de Arte Miami. Miami, Estados Unidos.
• 2005, Feria de Arco. Madrid, España.
• 2006, Casacord. Lima, Perú.
• 2006, Museo de Arte. Lima, Perú.
• 2006, Museo de Arte Pedro de Osma. Lima, Perú
• 2009, Lowe Gallery. Atlanta, Estados Unidos.
• 2010, 15 Aniversario Galería Lucía de la Puente. Lima, Perú.
• 2011, Feria de Arte Pinta. Londres, Reino Unido.
• 2011, Galería Tasneem. Barcelona, España.
• 2012, Lowe Gallery. Atlanta, Estados Unidos.
• 2012, Galería de Arte Petro Perú. Lima, Perú.
• 2012, Galería Arte Consult. Panamá, Panamá.
• 2014, Comprart. Museo de la Nación. Lima, Perú.
• 2015, Comprart. Lima, Perú.
• 2015, Casacord. Lima, Perú.^[8]​

• Cristina Gálvez. Magarita Checa. Esculturas/Dibujos. Galería Enrique Camino Brent.
• Carlos Rodriguez Saavedra. Margarita Checa. Canto a la vida. Galería Lucía de la Puente, Lima.
• Luis Eduardo Wuffarden Margarita Checa. Muestra Antológica, 1972 - 2013. Instituto Cultural Peruano Norteamericano.

• Página oficial de Margarita Checa
• Bill Lowe Gallery