Tras finalizar sus estudios secundarios, Srur ingresó a la Escuela Naval Militar en 1975. Egresó de dicha institución el 30 de diciembre de 1979 como guardiamarina de la Flota Naval.^[4]​

Sirvió como oficial en el destructor ARA Piedrabuena, el aviso ARA Francisco de Gurruchaga, la corbeta ARA Guerrico, el barreminas ARA Neuquén, el buque escuela ARA Libertad, el aviso ARA Teniente Olivieri, el destructor ARA Santísima Trinidad y la corbeta ARA Parker.^[4]​

Hacia 1994, Marcelo Srur realizó con éxito el Curso de Oficial de Estado Mayor, dictado en la Escuela de Guerra Naval que recae sobre la órbita del Estado Mayor Conjunto de las Fuerzas Armadas.^[4]​

En el año 1998, Srur se graduó en la Escuela Superior de Guerra de la Marina de Guerra del Perú del Curso de Comando y Estado Mayor. En ese mismo país, en la Universidad San Ignacio de Loyola, llevó a cabo el Curso de Programa de Administración.^[4]​

En 1999 sirvió como jefe del Cuerpo de Cadetes de la Escuela Naval Militar y con posterioridad estuvo a cargo de impartir tareas de enseñanza en la Escuela de Oficiales de la Armada.^[4]​

Se desempeñó como comandante de los siguientes buques: el aviso ARA Teniente Olivieri y la corbeta ARA Parker. Luego fue jefe de la División Corbetas. Luego de graduarse de Licenciado en Sistemas Navales en Propulsión, se desempeñó como director de la Escuela de Oficiales de la Armada.^[4]​

En mayo de 2011, el entonces contralmirante Srur asumió el cargo de director ejecutivo en la Dirección General del Material de la Armada. El 26 de junio de 2013, tras una renovación en la cúpula de las Fuerzas Armadas, se lo designó al frente del Comando de Adiestramiento y Alistamiento de la Armada. El 31 de diciembre de 2013 fue promovido a la jerarquía de vicealmirante. Previamente se desempeñó en la Agregaduría de Defensa Argentina.^[4]​porteña.^[5]​

El jueves 14 de enero de 2016, el vicealmirante Marcelo Srur fue nombrado jefe del Estado Mayor General de la Armada, reemplazando al almirante Gastón Erice, que pasó a retiro en el marco de una renovación de las cúpulas de las tres Fuerzas Armadas, llevada a cabo por el presidente Mauricio Macri, que significó también el relevo de los titulares del Ejército, teniente general (R) Ricardo Cundom por el general de brigada Diego Suñer y de la Fuerza Aérea, brigadier general (R) Mario Callejo por el brigadier Enrique Amrein.^[6]​^[7]​ Srur juró el 25 de enero de 2016 como jefe del Estado Mayor en una ceremonia de asunción celebrada en la plaza de armas del Edificio Libertador, con la presencia del ministro de Defensa Julio Martínez.^[3]​

Su ascenso al rango de almirante tuvo lugar el 6 de septiembre de 2016, a través del decreto 989/2016, en el cual el presidente Mauricio Macri ascendió también al grado inmediato superior a los titulares del Ejército y la Fuerza Aérea con fecha retroactiva al 18 de enero del mencionado año.^[8]​

El 15 de noviembre de 2017 tuvo lugar la pérdida de contacto con el submarino ARA San Juan que se encontraba navegando en las aguas del mar argentino. El navío tenía a bordo a 44 militares. Este suceso tomó estado público durante la noche del día siguiente y fue informado oficialmente dos días después por medio de un comunicado oficial de la Armada Argentina,^[9]​^[10]​ en el que se dio a conocer que se había iniciado el Protocolo SAR (búsqueda y rescate).^[11]​

Los días transcurrieron sin noticias de la nave extraviada hasta que se hizo un anuncio implícito de que el ARA San Juan podría haberse hundido por «implosión», muriendo toda su tripulación. A raíz de esto, varios medios de comunicación dieron a conocer los grande enfrentamientos internos que involucraron al ministro de Defensa Oscar Aguad y el almirantazgo de la marina de guerra. Aguad mostró su enfado al declarar que los jefes navales no lo mantuvieron informado adecuadamente de los hechos, incluyendo la desaparición misma del submarino, de la que el ministro se enteró por los medios de comunicación.^[12]​ El conflicto llegó a involucrar al presidente Mauricio Macri. El diario La Nación informó que el ministro Aguad abrió decenas de sumarios contra las máximas autoridades de la Armada,^[13]​ algo que el ministro desmintió luego.^[14]​

En 2021 el Consejo General de Guerra que investigó el hundimiento del submarino ARA San Juan, sancionó de forma unánime al exjefe de la Armada Marcelo Srur con 45 días de "arresto riguroso" por haber informado en forma “incompleta” sobre los sucesos acontecidos con el submarino. También dispuso la destitución del capitán de navío Claudio Javier Villamide.

Investigaciones del periodista Santiago Oulego rebelaron comunicaciones internas de la Armada que revelaban que el fue informado una hora después de la perdida de conexión con el submarino, el 16 de noviembre el gobierno pidiendo borrar la copia de los registros de la bitácora del submarino y cualquier información sobre su última misión y las coordenadas de su desplazamiento desde el día 15 de noviembre. Documentos internos señalaron la actitud de ocultamiento del gobierno, el ministro Óscar Aguad pidió mantener en secreto la desaparición y negar la misma, informando que cualquier personal perteneciente a la Armada sería sometido a Concejo de Guerra si rebelaba la desaparición del submarino. La Armada de Brasil había mantenido contacto con el submarino horas antes de su desaparición, el mismo día 15 la jefatura de operaciones de la Base Naval de Aratu informo al gobierno argentino de un posible incidente con la nave al cortarse las comunicaciones de forma intempestiva informado el día 16 de noviembre al gobierno de Mauricio Macri las últimas coordenadas posibles de la nave- los restos del submarino aparecerían a menos de dos millas nauticas del lugar indicado por la Armada brasileña.^[15]​

En la noche del viernes 15 de diciembre de 2017 el ministro de Defensa Oscar Aguad le solicitó al almirante Marcelo Srur su pase a retiro, justo a un mes de la desaparición del submarino ARA San Juan por lo cual quedó señalado ante la opinión pública como uno de sus principales responsables.^[16]​ Además, la decisión del saliente almirante de pasar a disponibilidad a dos altos oficiales navales por su presunta responsabilidad en la suerte del submarino generó una crisis interna dentro del almirantazgo de la Armada en la que tuvieron lugar una sucesión de pedido de pases a retiro en solidaridad con los dos oficiales cesanteados.^[16]​

El pase a retiro tuvo lugar el lunes 18 de diciembre y en su lugar fue designado el vicealmirante José Luis Villán.^[17]​ El decreto 1051/17 que reglamentó el pase a retiro de Srur lo señala como "obligatorio", lo que significa que -a diferencia del "retiro efectivo" - que Srur no podrá volver a participar de un acto naval, ni volver a usar el uniforme y queda imposibilitado de por vida a trabajar para la fuerza -ni siquiera en calidad de docente.^[18]​^[19]​ lonque contribuyó a desprestigiar ante la opinión pública la figura de Srur.

El sucesor Villán asumió el cargo de Jefe de Estado Mayor de la Armada de forma interina y ejerciendo en simultáneo como Subjefe del Estado Mayor Conjunto de las Fuerzas Armadas.^[20]​^[17]​ El nombramiento de Villán como titular de la armada pretendió no sólo restablecer nuevamente la cadena de mandos, sino también evitar un purga masiva de la actual cúpula naval y un quiebre entre ésta y la nueva camada de contralmirantes de 2018.^[21]​^[22]​ Producto de la crisis, el 28 de diciembre de 2017, también pasó a retiro el subjefe de la Armada, el vicealmirante Miguel Ángel Máscolo, quien veinte días antes en Mar del Plata, había tenido una reunión tensa y con expresiones políticamente incorrectas hacia los familiares de los submarinistas que fueron filtradas a internet, y posteriormente al medio Infobae en un archivo de audio.^[23]​^[24]​

La sucesión de relevos de la cúpula de la marina no implicó el abandono de las tareas de búsqueda del submarino extraviado.^[25]​ Meses después fue llamado a declarar en la causa, donde manifestó que le fue ocultado que el ARA San Juan estaba realizando tareas de espionaje a buques británicos cerca de Malvinas, afirmó ante la jueza de Caleta Olivia en la causa por la desaparición del submarino.^[26]​

Ante la Comisión Bicameral del Congreso de la Nación, que investiga el caso, el contralmirante López Mazzeo generó una nueva polémica desmintiendo al propio Marcelo Srur, asegurando que este conocía todos los detalles de los ejercicios navales.^[27]​

En 2020 sería Consejo General de Guerra destituyó al ex jefe de submarinos y arrestó al excomandante de la Armada imponiéndose una pena el arresto de 45 días que recayó sobre Marcelo Srur, quien fue llamado a indagatoria en la causa penal que tramita en la justifica federal por el naufragio que provocó la muerte de los 44 tripulantes.

Por decisión de la Justicia civil de Comodoro Rivadavia, fue imputado en la causa penal junto con Mauricio Macri y el ex ministro de Defensa Oscar Aguad, por la responsabilidad que le pudo caber a los tres por el hundimiento del submarino y las irregularidades en las búsqueda de la nave.^[28]​

La auditoría posterior rebeló reconocimiento de Srur sobre el estado en que se encontraba el submarino antes de zarpar informando se de “limitaciones sensibles” que tenía el navío.

“Este informe es de trascendental importancia porque fue aprobado por el Jefe del Estado Mayor de la Armada quien por ello se encontraba —al menos al mes de enero de 2017- en perfecto conocimiento de la situación operativa en que se encontraba el Submarino ARA San Juan”.^[29]​

• Distintivo Cuerpo de Comando - Escalafón Naval (Escuela Naval Militar)
• Curso de Comando y Estado Mayor (Escuela de Guerra Naval)