Fue hijo de Manuel Yrigoyen Arias y de María Mercedes Diez Canseco Olazábal. Su abuelo materno fue el general Manuel Diez Canseco Corbacho, quien participó de las guerras civiles y exteriores durante la primera etapa del periodo republicano.

Hizo sus estudios en el Colegio de los Jesuitas, ingresando después a la universidad donde se graduó de doctor en Ciencias Políticas. Dedicado durante algunos años a la agricultura, impulsó y desarrolló las negociaciones a su cargo, relacionándose con los círculos comerciales y agrícolas del país. Sus diversas actividades lo llevaron a desempeñar puestos de responsabilidad en el Banco Popular, del que llegó a ser gerente.

Fue presidente del Club Nacional durante el periodo 1931-1933 y miembro del Directorio del Banco Central de Reserva del Perú en ese mismo periodo.

Se casó el 8 de septiembre de 1900 con Angélica Puente y Salcedo, con quien tuvo 6 hijos.

Tuvo, además, una importante actividad pública. Como teniente alcalde primero y luego como alcalde de Lima, se dedicó a la realización de importantes obras de ornato y de organización comunal en la ciudad. Fue también un alto dirigente del Partido Civil.

En 1909 fue elegido diputado por Huari y en 1915 reelecto por esa misma provincia. Ese mismo año, formó parte de la junta directiva de la Cámara de Diputados en calidad de vicepresidente.