Originalmente formaba parte del Departamento de Investigación Científica e Industrial (DSIR), pero se separó y se semiprivatizó cuando se crearon los institutos de investigación de la corona en 1992 y comenzando a operar como una empresa estatal más que como un organismo gubernamental, lo que ha resultado en un mayor énfasis en la viabilidad financiera y que varios grupos privados busquen asesoramiento e información en Manaaki Whenua. Actualmente el presidente del comité es Colin Dawson.^[2]​

El sede principal está en Lincoln, cerca de Christchurch. También hay otras sedes en Auckland: en el campus Tamaki de la Universidad de Auckland, Hamilton, Palmerston North, Wellington y Dunedin.

Manaaki Whenua – Landcare Research posee varias colecciones de seres vivos de gran importancia para Nueva Zelanda. Hay información detallada sobre todos los especímenes disponible a través del sitio web de Datos de Colecciones Sistemáticas (SCD).

La colección internacional de microorganismos de plantas de Auckland contiene especímenes de bacterias y hongos vivos que se conservan en nitrógeno líquido o en ampolletas liofilizadas. Hay más de 20.000 ejemplares en la colección. ^[3]​

El Fungario de Nueva Zelanda (PDD) Te Kohinga Hekaheka o Aotearoa, ubicado en Auckland es la colección de hongos más importante de Nueva Zelanda. Tiene 109 584 especímenes de hongos secos, e incluye todas las especies tipo de los hongos de Nueva Zelanda.^[4]​ Es una de las colecciones más extensas sobre la biota fúngica de cualquier país.

La colección de artrópodos de Nueva Zelanda (NZAC) o Ko te Aitanga Pepeke O Aotearoa en maorí. El NZAC tiene más de 6 millones de especímenes (1 millón montados y 5 millones preservados en líquido), la colección de invertebrados terrestres más grande de Nueva Zelanda. Además de su valor para el estudio de la taxonomía y la sistemática, las decisiones de cuarentena y control fronterizo se basan en la colección (por ejemplo, verificar la presencia o ausencia de especies en Nueva Zelanda) y contribuye a los listados de especies de insectos amenazadas. La colección se resguarda en la sede de Tamaki de Landcare Research.

La Colección Nacional de Nematodos de Nueva Zelanda (NNCNZ) contiene miles de especímenes de nematodos. Está resguardada dentro de la Colección de Artrópodos de Nueva Zelanda.

El Herbario Allan (CHR) Te Kohinga Tipu o Aotearoa en Lincoln, contiene especies de todo el mundo, pero se especializa en plantas (autóctonas y exóticas) de la región de Nueva Zelanda y el Pacífico. También cuenta con colecciones especializadas de semillas, frutos, madera, cutículas de hojas, especímenes conservados en líquido y portaobjetos de microscopio. Las muestras más antiguas son los 91 especímenes duplicados y recolectados por Banks y Solander durante el primer viaje del capitán Cook a Nueva Zelanda en 1769-1770.

Actualmente hay más de 550 000 especímenes en el Herbario Allan y cada año se añaden entre 5000 y 8000 más, 65% de los especímenes son plantas autóctonas y el resto son plantas naturalizadas, cultivadas y extranjeras. Lleva el nombre de Harry Allan, en reconocimiento a sus contribuciones a la botánica de Nueva Zelanda.

Manaaki Whenua es un kaitiaki de una colección etnobotánica de variedades tradicionales de tejido de harakeke (lino de Nueva Zelanda, Phormium spp.) donada por René Orchiston de Gisborne. Los 50 harakeke fueron seleccionados hace mucho tiempo de rodales naturales y cultivados por tejedores maoríes por las propiedades especiales de sus hojas y fibras. Existen variedades especialmente indicadas para la confección de kete, whariki, piupiu y mantos.

Manaaki Whenua investiga los procesos que mantienen los ecosistemas de Nueva Zelanda, permiten que la flora, la fauna y los hongos naturales prosperen y protegen el suelo y las cuencas para distintos fines productivos y de otros tipos. Se investigan los impactos de la alteración de los ecosistemas, los riesgos de bioseguridad provocados por malezas, plagas y microorganismos importados; la contaminación de la tierra, el agua y el aire causados por la producción de compuestos naturales, manufacturados o de desecho. También se realizan investigaciones para desarrollar herramientas que ayuden a mitigar el uso ineficiente de los recursos y el exceso de desperdicio, y sistemas diseñados para mejorar la productividad del uso de los recursos, el estilo de vida y la viabilidad empresarial. Las investigaciones se centran en seis áreas clave:

• Conservar y restaurar la biodiversidad y la resiliencia saludable de los ecosistemas naturales de Nueva Zelanda;
• Reducir el impacto de plagas, enfermedades y malezas en los ecosistemas naturales y gestionados;
• Comprender, mitigar y adaptarse a los impactos del cambio climático;
• Mantener la salud a largo plazo de los suelos, las vías fluviales y los paisajes para la viabilidad continua de nuestros entornos rurales;
• Mejorar la biodiversidad urbana y desarrollar enfoques de bajo impacto para entornos construidos; y
• Fomentar prácticas empresariales ambientalmente sostenibles y competitivas a nivel mundial.

Manaaki Whenua ha organizado varios eventos BioBlitz : un sondeo de todas las especies en un área determinada. El primer BioBlitz de Nueva Zelanda se realizó en el suburbio de St Heliers en Auckland del 30 de abril al 1 de mayo de 2004; en los remanentes de un bosque nativo en la reserva Dingle Dell, se encontraron 925 especies diferentes, y 631 especies en un barranco de bosque nativo en la escuela primaria Meadowbank. Un segundo BioBlitz en el Dominio de Auckland el 12 y 13 de marzo de 2005 encontró 1575 especies distintas. Otro BioBlitz tuvo lugar en el Parque Hagley en Christchurch el 8 y 9 de abril; allí se encontraron 1.197 especies. En 2006 se celebró BioBlitz en Hamilton; este evento descubrió 948 especies.^[5]​