• Les champignons comestibles du canton de Neuchatel et les espèces vénéneuses avec lesquelles ils pourraient être confondus, ed. Imprimerie de C. Leidecker, 1861
• Nouvelles Jurassiennes, ed. Librairie S. Delachaux, 1870
• Le pinson des colombettes, suivi de: Le chat sauvage du Gor de Brayes, ed. Sandoz et Fishbacher, 1876
• Louis Agassiz son activité à Neuchâtel comme naturaliste et comme professeur de 1832 à 1846, 1881
• Récits neuchâtelois,ed. A. Imer., F. Payot, 1886
• Guide du voyageur dans le canton de Neuchàtel, avec Louis Guillaume, 1891.

En Boudry y en Neuchâtel, dos comunas del cantón de Neuchâtel, poseen una calle con su nombre, en su honor.

• La abreviatura «Favre» se emplea para indicar a Louis Favre como autoridad en la descripción y clasificación científica de los vegetales.^[1]​

• «Louis Favre». Índice Internacional de Nombres de las Plantas (IPNI). Real Jardín Botánico de Kew, Herbario de la Universidad de Harvard y Herbario nacional Australiano (eds.). 

• Biografía e imagen del autor
•   Wikispecies tiene un artículo sobre Louis Favre.

1. ↑ Todos los géneros y especies descritos por este autor en IPNI.