La clasificación de países basada en los coeficientes de país se utiliza para determinar la cantidad de clubes de cada federación nacional que participan en las distintas etapas de la BCL:^[2]​

• Todos los países, si participaron, tienen al menos un equipo clasificado.
• Los ganadores de la Liga de Campeones de Baloncesto 2023-24 reciben una plaza adicional si no se clasifican para la Liga de Campeones de Baloncesto 2024-25 a través de su liga nacional.^[3]​
• El organizador podrá conceder el acceso a la Liga mediante la asignación de hasta 4 invitaciones a la Temporada Regular o a las Rondas de Clasificación.^[3]​
• Si uno o más clubes no hacen uso de su derecho a participar en la Liga de Campeones de Baloncesto, el organizador podrá decidir asignar la(s) plaza(s) respectiva(s) a otros clubes de la misma u otras Federaciones Nacionales.^[3]​

Para la Liga de Campeones de Baloncesto 2024-25, los países reciben sus plazas según sus coeficientes de país de 2024, que tienen en cuenta su rendimiento desde 2021-22 hasta 2023-24.

Entre paréntesis se muestra cómo se clasificó cada equipo para el lugar de su ronda inicial:

• TH: Campeones
• FEC: Campeones de la Copa de Europa FIBA
• 1º, 2º, 3º, 4º, etc.: Posiciones de la liga de la temporada anterior
• WC: Invitación^[3]​
• AV: Vacante asignada^[3]​

Un total de 54 árbitros dirigirán partidos en la temporada 2024-25 de la Basketball Champions League:^[8]​ Después de la temporada 2023-24, cinco árbitros abandonaron la plantilla y se incorporaron dos.

El sorteo de las rondas clasificatorias se celebró el 26 de junio de 2024 en la Casa Patrick Baumann en Mies, Suiza.^[9]​^[10]​

Los 24 equipos se enfrentarán en cuatro torneos de ronda clasificatoria, dos de los cuales pertenecen a la Ruta de Campeones, que contiene a los campeones de las ligas nacionales, y los otros dos a la Ruta de la Liga, que contiene al resto de equipos que compiten por clasificarse a la fase regular. En cada ruta, los equipos fueron clasificados en los seis bombos ordenados por el ranking de clubes y por el ranking de países para los clubes que aún no han participado en la competición. Los equipos de los bombos 1 y 2 fueron sorteados directamente para las semifinales de los torneos, mientras que los equipos de los otros cuatro bombos ingresarán al torneo desde los cuartos de final. Los cuatro ganadores de las finales se clasificarán para la temporada regular de la Basketball Champions League 2024-25 y se unirán a los 28 equipos clasificados directamente en el cuadro principal. El resto de los equipos se clasificarán, si lo solicitan, para la Copa FIBA ​​Europa 2024-25.

El torneo 1 se disputó del 17 al 21 de septiembre de 2024 en el Gloria Sports Arena en Antalya, Turquía.^[11]​

Fuente: FIBA

El torneo 2 se disputó del 18 al 22 de septiembre de 2024 en el Gloria Sports Arena en Antalya, Turquía.^[11]​

Fuente: FIBA

El torneo 3 se disputó del 17 al 21 de septiembre de 2024 en el Gloria Sports Arena en Antalya, Turquía.^[11]​

Fuente: FIBA

El torneo 4 se disputó del 18 al 22 de septiembre de 2024 en el Gloria Sports Arena en Antalya, Turquía.^[11]​

Fuente: FIBA

Los 28 equipos que participaron directamente en la temporada regular se dividieron en cuatro grupos según la clasificación de clubes y, para los clubes que aún no participaron en la competición (temporada regular), según la clasificación de países de los últimos tres años. La regla de protección de países se aplicará en la fase del sorteo. Los clubes no pueden ser sorteados en grupos con otros clubes del mismo país.^[9]​

Los 28 equipos jugarán entre sí en una fase de grupos de ocho grupos con cuatro equipos. El equipo que ocupe el primer puesto de cada grupo pasará directamente a los octavos de final. Los equipos que ocupen el segundo y el tercer puesto jugarán en los play-in. El ganador de cada partido de play-in pasará a los octavos de final. Los play-in se jugarán en formato al mejor de 3. En los octavos de final, los equipos se dividirán en cuatro grupos de cuatro equipos. Cada equipo jugará contra cada uno de los otros equipos en los octavos de final. Los dos primeros equipos de cada grupo se clasificarán para los cuartos de final. Los cuartos de final se jugarán en formato al mejor de 3. El ganador de cada cuarto de final podrá participar en la Final Four de la Basketball Champions League en mayo de 2025.^[10]​

Para determinar la clasificación, en caso de que los equipos tengan los mismos puntos y la misma cantidad de victorias en sus enfrentamientos directos al final de la jornada 6: el desempate será para el equipo con:^[12]​

1. Mayor diferencia de puntos en los partidos entre ellos.
2. Mayor cantidad de puntos anotados en los partidos entre ellos.
3. Mayor diferencia de puntos en todos los partidos del grupo.
4. Mayor cantidad de puntos anotados en todos los partidos del grupo.

Los play-ins se disputaron del 7 al 22 de enero de 2024. Los equipos clasificados en segundo y tercer lugar de sus respectivos grupos de la Basketball Champions League, pasaron a los play-ins. Los ganadores avanzarán a los octavos de final. Los partidos de ida se jugaron el 7 y 8 de enero, los de vuelta el 14 y 15 de enero y, en caso necesario, los de tercera ronda se jugarán el 21 y 22 de enero.

Los octavos de final se disputarán del 28 de enero al 26 de marzo de 2025. Los grupos estarán formados por los ganadores de cada grupo de la fase regular y por los ocho ganadores de los play-ins. Los 16 equipos se dividirán en 4 grupos de 4 equipos cada uno. Los dos primeros de cada grupo avanzarán a los cuartos de final.