Se organiza en base al convenio de colaboración entre la Federación Vasca de Natación y la Federación Navarra de Natación, estando abierta a la participación de otros equipos y federaciones de la zona (Cantabria, Castilla y León,...).^[1]​

Los títulos desde 1997, año en el que se empieza el acuerdo vasco-navarro:^[2]​

(1) En el año 2020, la liga sénior masculina se dio por suspendida debido al confinamiento por coronavirus. Los partidos que restaban por disputarse se suspendieron y las clasificaciones, tal y como se encontraban en el momento de su paralización por la declaración del estado de alarma sanitaria, se dieron como definitivos.