Kyptoceras fue nombrado por Webb (1981). Su especie tipo es Kyptoceras amatorum. Es a su vez el género tipo de la tribu Kyptoceratini. Fue asignado a Kyptoceratini por Webb (1981), Prothero (1998), Webb et al. (2003) y Prothero y Ludtke (2007).^[2]​^[3]​^[4]​

Kyptoceras es el último miembro conocido de su familia. Se cree que los protocerátidos fueron empujados a la extinción por los herbívoros pastadores más avanzados, pero en Florida, en donde aún había extensiones relativamente grandes de bosques, los prtocerátidos pudieron subsistir. El nombre del género se refiere a sus cuernos doblados, ya que los dos cuernos sobre los ojos se curvaban hacia su cabeza, mientras los dos cuernos nasales apuntaban hacia adelante. El nombre de la especie, amatorum, es un homenaje a los coleccionistas de fósiles aficionados, incluyendo a Frank Garcia (de Ruskin, Florida), el aficionado que encontró y donó los restos fósiles al Museo de Historia Natural de Florida.

Sus fósiles se han encontrado en:

• Tiger Bay Mine, Formación Upper Bone Valley, Condado de Polk (Florida)
• Lee Creek Mine, Formación Yorktown, Condado de Beaufort (Carolina del Norte)

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