Macdonald nació en Glasgow, Escocia. Su madre era una ejecutiva de ventas de la industria de prendas de vestir. Sus padres se divorciaron cuando ella era joven. Ella y su hermano menor fueron criados por su madre en una finca en la ciudad de Newton Mearns. Macdonald asistió a la Escuela Secundaria Eastwood. La familia se mudó con frecuencia de domicilio cuando era una niña, en parte debido a su modesta posición financiera.

Macdonald se independizó cuando tenía 17 años de edad. Asistió a la universidad mientras vivía con un amigo en Glasgow, pero pronto abandonó los estudios. Expresó su interés por entrar en una escuela de teatro, pero nunca lo hizo, por su timidez.

En 2003 se casó con el músico Dougie Payne, del que se separó en 2017.^[1]​ Tuvieron dos hijos: Freddie Peter Payne, nacido el 9 de marzo de 2008,^[2]​ y Theodore William, nacido el 8 de diciembre de 2012.^[3]​