El torneo se disputó en un formato de todos contra todos a tres rondas, de manera tal que cada equipo debió jugar dos partidos de local y uno de visitante (o viceversa) contra sus otros nueve contrincantes. Una victoria se puntuaba con tres unidades, mientras que por un partido ganado en tiempo suplementario se otorgaban dos puntos. Por otro lado, la victoria por penales valía un punto y la derrota, ninguno.

Para desempatar se utilizaron los siguientes criterios:

1. Puntos
2. Diferencia de goles
3. Goles anotados
4. Resultados entre los equipos en cuestión

Los cuatro mejores del torneo clasificaron a los play-off por el campeonato, que se decidieron de esta manera:

1. En la primera ronda se enfrentaron el tercero contra el cuarto de la tabla de posiciones; en caso de que el marcador siguiera igualado al término del tiempo reglamentario, se jugaría una prórroga con gol de oro. En caso de que prosiguiera la paridad en el resultado, se ejecutaría una tanda de penales.
2. En la segunda ronda se cruzaron el segundo de la tabla de posiciones frente al ganador de la primera ronda, pero a partir de aquí se definiría en dos partidos. Si el marcador global siguiera igualado al término del tiempo reglamentario de la vuelta, se disputaría una prórroga con gol de oro. Finalmente, en caso de que prosiguiera la paridad en el resultado, se ejecutaría una tanda de penales.
3. En la final se enfrentaron el mejor de la tabla de posiciones contra el vencedor de la segunda ronda. En este caso, se siguieron las mismas reglas que para la ronda anterior.

• Copa de la Liga de Corea 1999
• Copa de la Liga de Corea 1999 (Copa Suplementaria)
• Korean FA Cup 1999

• K League 1999 en la página oficial de RSSSF (en inglés)