Gran parte de la jugabilidad se basa en los Koma (paneles en japonés, referido a los paneles del manga) que representa a los personajes para crear mazos en ranuras de 4 X 5 cuadros. Los personajes cambian de forma de cuadros y aparecen desde 1 hasta 8 cuadros. Los personajes se dividen en 3 categorías: Atacantes, Soporte y Ayuda. Debe tener uno de cada tipo y asignar a un líder para que el mazo sea jugable. Los personajes atacantes usan 4 a 8 cuadros que representan a personajes jugables. Los de soporte usan 2 o 3 cuadros y son llamados para atacar, recuperar o causar estados. Los de ayuda mejoran a los atacantes, si son puestas a su lado.

Se confirma la novedad que todo poseedor de Nintendo DS deseaba, la opción Wi-Fi estuvo disponible aunque también se tendría que mencionar que a finales de 2014 los servidores oficiales fueron apagados lo cual hace limitada esta función.

Además, se introdujo 6 tipos de gemas, que son el dinero del juego, que son usados para comprar funciones o Komas. Todos los personajes empiezan con un Koma y se divide en 3 ramas para comprar. Las ranuras superiores generalmente son soportes, las ranuras centrales generalmente son atacantes y las ranuras inferiores generalmente contienen funciones, como escenarios, BGM, ayudantes (que dan explicación a varias opciones de interfaz), o nuevas ramificaciones para los personajes existentes.

En la secuela se puede apreciar el mismo estilo gráfico del primer título que sería un juego parecido al ya famoso Super Smash Bros pero con un estilo en 2D y presentados en páginas de manga y sin ningún cambio en los efectos de sonido, ya que en el pasado solo se escuchaba el sonido del impacto o del ataque sin incluir las voces del anime, un gran detalle ya que muchas de las series que se muestran no han sido animadas por lo cual se quedarían cortos en el momento de incluir las voces. Ciertas partes de las páginas pueden destruirse. Los personajes jugables son eliminados si su barra de vida cae a 0 o si sale del escenario.

Notas

• LV: nivel o N.º de cuadros. Se organiza por LV 1 (Ayuda), 2 y 3 (Soporte) y 4 o + (Atacante).
• Personajes al lado de N.º de LV corresponde a atacantes mejorados.
• Series marcadas en * aparecen en este juego.

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