Trabajó siete años para la revista Cambio 16 y en 1989 ingresó en el equipo fundacional del periódico español El Mundo. A partir de ese momento cubrió los principales conflictos mundiales de finales del siglo XX, como las Guerras yugoslavas o la Guerra del Golfo. De estilo más bien atípico, escribía sus crónicas desde la mirada de los más débiles y mostraba los conflictos a través de quienes más los sufren.

El 19 de noviembre de 2001 fue asesinado^[1]​ en una emboscada contra un convoy de periodistas en el puente de Pul-i-Estikam, en algún punto entre Kabul y Jalalabad (Afganistán), junto a otros tres compañeros de profesión: la corresponsal italiana del diario Il Corriere della Sera, Maria Grazia Cutuli, el cámara australiano Harry Burton, que trabajaba para la agencia Reuters, y el fotógrafo afgano Azizula Haidari.

El 8 de octubre de 2007, dos días antes del Día Mundial contra la Pena de Muerte, fue ejecutado en Kabul Reza Khan, el asesino de Julio Fuentes,^[2]​ tras ser condenado por un tribunal en 2004. El Gobierno español, recogiendo los deseos de los familiares de los periodistas muertos, había pedido que se conmutara esa pena de muerte.^[3]​

• En abril de 1997 publicó su libro titulado "Sarajevo Juicio final".
• En 1998 publicó el libro "Resistencia Humana".
• En febrero de 2000 publicó en Plaza & Janes una obra de ficción: "Rebelión", basada en una posible guerra civil europea al final del siglo XXI.

• 2002: ganador del Premio Ciudad de ALCALÁ de periodismo "Manuel Azaña"

• Julio Fuentes. El testimonio más humano de la guerra, El Mundo.
• Viaje al lugar del asesinato del Julio Fuentes
• El último día de un reportero, El Mundo.
• Podcast EL MUNDO: Julio Fuentes, el reportero total cuyas crónicas leíamos como la Biblia
• Rtve Play: El periodista Julio Fuentes, asesinado en Afganistán (año 2001)