Debutó con Brondby IF, jugó la Liga Europa de la UEFA 2010-11, perdiendo en la ronda de play-off contra Sporting Lisboa. Por 3 años consecutivos quedó en el 3er lugar de la Superliga de Dinamarca. Para la temporada 2013-14 se marchó como libre al FC Nordsjælland para jugar la Liga de Campeones de la UEFA 2013-14.

A mediados de 2014 fue transferido al FK Austria Viena. Clasificó a la Liga Europa de la UEFA 2016-17 luego de quedar 3.º en la Bundesliga 2015-16. Llegó hasta la fase de grupos de la Liga Europea.

A mediados de 2017 fue transferido al Udinese Calcio por 1,50 mill. €. Firmó hasta el 30 de junio de 2021.

Tras jugar con la selección de fútbol sub-16 de Dinamarca, la sub-17, la sub-18, la sub-19, y la sub-21, Jens Stryger Larsen fue convocado por el seleccionador Åge Hareide para los partidos amistosos contra Armenia y Liechtenstein.^[1]​ Finalmente el 31 de agosto de 2016 hizo su debut con la selección absoluta en un encuentro contra Liechtenstein que finalizó con un resultado de 5-0 a favor del combinado danés tras los goles de Viktor Fischer, Andreas Cornelius, un doblete de Nicolai Jørgensen y otro del propio Jens Larsen.^[2]​ Además llegó a disputar seis partidos de la clasificación para la Copa Mundial de Fútbol de 2018.

• Ficha del jugador en national football teams (en inglés)
• Ficha del jugador en footballdatabase
• Ficha del jugador en eu-football (en inglés)