Después de la intensa gira por su álbum Dirt, la banda decidió explorar un sonido más íntimo y acústico. Según el guitarrista y vocalista Jerry Cantrell, Jar of Flies fue un proyecto espontáneo motivado por el deseo de experimentar con nuevas texturas musicales y un estado emocional más vulnerable.^[3]​

El bajista Mike Inez se unió formalmente a la banda para esta grabación, reemplazando a Mike Starr. La producción estuvo a cargo del grupo junto con Toby Wright, quien ya había trabajado con ellos en Dirt. La grabación se realizó en solo siete días, durante los cuales la banda compuso y grabó la mayoría de las canciones en sesiones nocturnas.^[4]​

Jar of Flies se caracteriza por su predominancia acústica, alejándose del sonido más pesado y eléctrico de sus trabajos anteriores. Las canciones presentan arreglos más melódicos y armoniosos, combinando elementos de folk rock, blues y rock alternativo. Las letras, escritas en gran parte por Layne Staley, abordan temas como la soledad, la desesperación y la lucha interna, reflejando la turbulenta situación emocional que vivía el vocalista en esa época.^[5]​

Una de las canciones más emblemáticas, "Nutshell", ha sido considerada una de las composiciones más sinceras y vulnerables de la banda, dedicada a la memoria de los miembros originales Layne Staley y Mike Starr.^[6]​

El EP fue recibido con elogios por parte de la crítica, destacándose por su honestidad emocional y calidad compositiva. AllMusic otorgó 4 de 5 estrellas, resaltando la cohesión de los temas acústicos y la madurez de la banda.^[7]​ Rolling Stone también le otorgó una valoración favorable, señalando que el trabajo mostró una nueva faceta más suave y melancólica del grupo.^[8]​

Además, el disco tuvo un impacto comercial significativo, vendiendo más de tres millones de copias solo en Estados Unidos y siendo certificado como triple platino por la RIAA.^[9]​

Jar of Flies se convirtió en un referente para la música acústica dentro del movimiento grunge, influyendo en numerosas bandas posteriores que exploraron sonidos más íntimos y melódicos. Su éxito en las listas marcó un precedente, demostrando que un EP acústico podía tener un impacto comercial tan fuerte como un álbum tradicional.^[10]​

Las canciones "No Excuses" e "I Stay Away" también se convirtieron en clásicos dentro del repertorio de la banda y fueron lanzadas como sencillos con buen desempeño en las listas de rock alternativas.^[11]​

1. Rotten Apple (Cantrell, Inez, Staley) – 6:58
2. Nutshell (Cantrell, Inez, Kinney, Staley) – 4:19
3. I Stay Away (Cantrell, Inez, Staley) – 4:14
4. No Excuses (Cantrell) – 4:15
5. Whale & Wasp (Cantrell) – 2:37
6. Don't Follow (Cantrell) – 4:22
7. Swing on This (Cantrell, Inez, Kinney, Staley) – 4:04

• Layne Staley – voz principal
• Jerry Cantrell – guitarra, voz
• Mike Inez – bajo, guitarra, coros
• Sean Kinney – batería
• David Atkinson – armónica
• Justine Foy – violonchelo
• Matthew Weiss – violín

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