Klein nació el 15 de agosto de 1685 en Danzig (Gdańsk) en polaco Prusia Real. Estudió la historia natural y utilizó su posición como secretario de la ciudad para fundar un jardín botánico allí (ahora se llama Ogród Botaniczny w Oliwie). Su yerno fue Daniel Gralath, un físico que se convertiría en alcalde.

Trató con pequeñas cuestiones de nomenclatura zoológica y creó su propio sistema de clasificación de los animales, que se basa en el número, la forma y posición de las extremidades. Por su trabajo en el campo de las ciencias naturales, Klein había sido galardonado con la pertenencia a varias sociedades científicas, entre ellas la Royal Society de Londres y la Sociedad de Investigación de Danzig. También fue corresponsal del pastor Luterano Friedrich Christian Lesser.. Él murió 27 de febrero de 1759 en Königsberg, Prusia (ahora Kaliningrado, Rusia ).

• Neuer Schauplatz der Natur, nach den Richtigsten Beobachtungen und Versuchen, in alphabetischer Ordnung, vorgestellt durch eine Gesellschaft von Gelehrten. Weidmann, Leipzig. v. 4 : 1–874. 1777

• Natürliche Ordnung und vermehrte Historie der vierfüssigen Thiere. Schuster, Danzig 1760

• Vorbereitung zu einer vollständigen Vögelhistorie. Schmidt, Leipzig, Lübeck 1760

• Stemmata avium. Holle, Leipzig 1759

• Tentamen herpetologiae. Luzac jun., Leiden, Göttingen 1755

• Doutes ou observations de M. Klein, sur la revûe des animaux, faite par le premier homme, sur quelques animaux des classes des quadrupedes & amphibies du systême de la nature, de M. Linnaeus. Bauche, Paris 1754

• Ordre naturel des oursins de mer et fossiles, avec des observations sur les piquans des oursins de mer, et quelques remarques sur les bélemnites... Bauche, Paris 1754

• Tentamen methodi ostracologicæ  sive  Dispositio naturalis cochlidum et concharum in suas classes, genera et species. Wishoff, Leiden 1753

• Quadrupedum dispositio brevisque historia naturalis. Schmidt, Leipzig 1751

• Historiae avium prodromus. Schmidt, Lübeck 1750

• Mantissa ichtyologica de sono et auditu piscium  sive  Disquisitio rationum, quibus autor epistolae in Bibliotheca Gallica de auditu piscium, omnes pisces mutos surdosque esse, contendit. Leipzig 1746

• Historiæ piscium naturlais promovendæ missus quartus de piscibus per branchias apertas spirantibus ad justum numerum et ordinem redigendis. Gleditsch & Schreiber, Leipzig, Danzig 1744

• Testaceo-Theologia. Con Friedrich Christian Lesser. Blochberger, Leipzig, Frankfurt 1744–70

• Summa dubiorum circa classes quadrupedum et amphibiorum in celebris domini Caroli Linnaei systemate naturae. Leipzig, Danzig 1743

• Naturalis dispositio echinodermatum. Schreiber, Danzig 1734

• Kurtzer Entwurff einer Lithotheologie. Con Friedrich Christian LesserNordhausen. 1732

• Descriptiones tubulorum marinorum. Knoch, Danzig 1731

• An Tithymaloides. Schreiber, Danzig 1730

• La abreviatura «Klein» se emplea para indicar a Jacob Theodor Klein como autoridad en la descripción y clasificación científica de los vegetales.^[1]​

• Geus, Armin: Die Kontroverse von R. A. F. de Réaumur und J. Th. Klein über Bau und Wachstum der Schneckenschalen. in Janus. no. 65, Ámsterdam 1978

• «Jacob Theodor Klein». Índice Internacional de Nombres de las Plantas (IPNI). Real Jardín Botánico de Kew, Herbario de la Universidad de Harvard y Herbario nacional Australiano (eds.). 

•   Wikimedia Commons alberga una categoría multimedia sobre Jacob Theodor Klein.
•   Wikispecies tiene un artículo sobre Jacob Theodor Klein.
• ADB (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
• Historia de la Sociedad Científica de Danziger
• Obra de Klein - SCD de la Univ. de Estrasburgo