Las rutas de pasajeros de Ferrocarriles de Israel están divididas en nueve líneas operativas:

Ferrocarriles de Israel cuenta con los siguientes trenes de pasajeros y locomotoras:

• Locomotoras diésel-eléctricas EMD G12 Bo-Bo.^[4]​ Israel importó veintitrés de EMD entre 1954 y 62 y capturó cuatro más de Egyptian National Railways en la Guerra de los Seis Días, de 1967. Algunas unidades se han retirado de circulación y en la actualidad se encuentran en el Museo de Ferrocarriles de Israel, en Haifa.^[5]​
• Locomotoras diésel-eléctricas EMD G16 Co-Co, construidas por Egyptian National Railways entre 1960 y 61 y capturadas durante la Guerra de los Seis Días.^[6]​ Una de estas locomotoras se encuentra en el museo.^[5]​
• 12 locomotoras diésel-eléctricas EMD G26 Co-Co, introducidas entre 1971 y 82.^[6]​
• Locomotoras Vossloh Euro (EMD) añadidas en 2011.
• Locomotoras de diésel Alstom/EMD JT42BW y JT42CW, agregadas en 1996.
• ABB Scandia IC3 introducidas en 1992.
• Trenes GEC Alstom introducidos en 1996, armados en Israel por Haargaz.
• Trenes de doble piso Bombardier, agregados en 2001; en 2010 se encargaron más unidades a Bombardier.^[7]​
• Trenes de pasajeros Siemens Viaggio Light (configurados como "tren ISR SDPP"),^[8]​^[9]​ agregados en 2009.
• Locomotoras Alstom GA-DE900 AC.

• Boris Kidrič/Metalka "Yugo", agregada entre 1964 y 72^[10]​^[11]​
• Trenes Esslingen (introducidos en 1956)

• El 26 de diciembre de 1963, dos trenes de pasajeros de la por aquel entonces línea principal de una sola mano que conectaba Tel Aviv con Haifa chocaron de frente en la estación de Bet Yehoshua, al sur de Netanya.^[12]​ El tren que iba hacia el norte había pasado una luz roja y su locomotora continuó rodando hasta que chocó al otro tren.^[13]​ Ninguno de los trenes se descarriló, pero en uno de los trenes se rompió un acoplador y causó que se separaran los tres vagones posteriores a él.^[14]​ El freno automático tendría que haber detenido a los vagones sueltos, pero no lo hizo, por lo que empezaron a rodar marcha atrás hacia el sur.^[14]​ 55 personas resultaron heridas, pero solo tres de ellas tuvieron que ser trasladadas a un hospital.^[14]​ Los maquinistas sobrevivieron pero los dos trenes quedaron totalmente destruidos.^[14]​
• En 1972, un tren chocó contra un camión militar y causó la muerte de 18 soldados.
• El 11 de junio de 1985, un tren chocó con un autobús escolar y causó la muerte de 19 niños y tres adultos, cerca del moshav de HaBonim.
• El 21 de junio de 2005, un tren IC3 chocó con un camión de carga cerca del kibbutz Revadim; ocho personas fallecieron y 198 resultaron heridas.^[15]​
• El 8 de julio de 2005, un tren chocó con un camión entre Kiryat Gat y Ahuzam; causó la muerte del ingeniero ferroviario y dejó 38 heridos.^[16]​^[17]​
• El 12 de junio de 2006, un tren colisionó con otro camión cerca de Beit Yehoshua, dejando cinco muertos y más de 80 heridos.^[18]​^[19]​
• El 27 de diciembre de 2009, un tren chocó con un auto cerca de Kiryat Gat. El conductor, que falleció en el accidente, había continuado su camino sin detenerse para dejar pasar al tren.^[20]​
• El 5 de agosto de 2010, un tren chocó con un minibus cerca de Kiryat Gat, con un saldo de siete muertos y seis heridos. El accidente tuvo lugar a las 19:05, hora local, en la Ruta 353, aparentemente cuando el minibus intentaba cruzar un paso a nivel.^[21]​^[22]​
• El 28 de diciembre de 2010, se desató un incendio en un tren cerca del kibbutz Yakum, probablemente por un cortocircuito: 116 personas resultaron heridas.^[23]​
• El 7 de abril de 2011, dos trenes chocaron de frente cerca de Netanya, con un saldo de 59 heridos.^[24]​

• Transporte en Israel
• Anexo:Lista de empresas de ferrocarriles

• Cotterell, Paul (1986). The Railways of Palestine and Israel. Tourret Publishing. ISBN 0-905878-04-3. 

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• Sitio web oficial de Israel Railways (en hebreo)