Han pasado 10 años desde la final del TFI. El fútbol ahora es controlado por una misteriosa organización llamada "Sector Quinto", convirtiendo este deporte en oscuras y violentas batallas,y que además arregla los partidos. Para la gente, el fútbol ya no tiene esperanza. Tenma Matsukaze/Arion Sherwind es un chico de 13 años proveniente de Okinawa que empieza la secundaria en el Instituto Raimon, donde siempre ha soñado entrar en el equipo de fútbol, ya que cuando era pequeño alguien misterioso lo salvó de que se le cayeran un montón de tablas de madera encima, chutando un balón de fútbol que tenía dibujado el símbolo de Raimon. Arion juega de centrocampista y, a pesar de que aparentemente no es demasiado talentoso, salvo para regatear, es optimista e intenta mejorar día a día. Con su llegada, el equipo Raimon recupera la esperanza de volver a jugar algún día al verdadero fútbol; es así como este nuevo equipo, bajo las órdenes del ahora entrenador Satoru Endo/Mark Evans, se reencontrarán con viejos amigos, conocerán otros nuevos, lucharán contra nuevos y fuertes oponentes y lograrán la revolución contra el Sector Quinto y recuperarán el significado del verdadero fútbol.

Tras el final del torneo Camino Imperial y de haber derrotado al Sector Quinto, Arion viaja a Okinawa donde enseña fútbol a niños de distintas escuelas gracias a un programa que fundó Axel Blaze. Pero, cuando Arion regresa al Instituto Raimon y se dirige como siempre al club de fútbol se encuentra con que las cosas han cambiado. Ahora los miembros de Raimon no son futbolistas, es más, el club de fútbol ya ni siquiera existe, por lo que los antiguos integrantes del equipo ahora pertenecen a distintos clubs. Esto provocará que el propio Arion se pregunte si se encuentra en un mundo paralelo. Justo entonces hace su aparición un nuevo enemigo llamado Alpha, capitán del Protocolo Omega y quien trata de quitarle el fútbol que tanto quiere Arion. Más adelante aparece un nuevo compañero y amigo llamado Fey Rune, quien ayudara a Arion a recuperar el fútbol perdido, y es así como un nuevo viaje comienza para Arion, en el que conocerá nuevos amigos y enemigos. Arion y sus compañeros buscarán comprender los cambios que han ocurrido en el espacio-tiempo y recuperar la existencia del fútbol. Además, poco a poco, con la ayuda de David Evans (ahora convertido en una "Chrono Stone") buscaran formar el equipo definitivo, formado por importantes personajes históricos para poder vencer al Dorado.

En Inazuma Eleven GO: Galaxy, el Campeonato Mundial de Fútbol Juvenil, el Torneo Frontier Internacional Versión 2 (TFIV2) se lleva a cabo, por lo que la selección para Inazuma Japón vuelve a estar abierta. Sin embargo, para representar a Japón, los jugadores elegidos nunca antes vistos, no saben nada acerca de como jugar fútbol y tampoco tienen ninguna intención de jugarlo, aunque son muy talentosos en otras actividades. Entonces, Arion, Riccardo y Victor (los únicos miembros que tienen experiencia con el fútbol) tendrán el deber de enseñar a sus nuevos compañeros a jugar al fútbol y hacerles comprender lo divertido que puede llegar a ser. Más tarde se dan cuenta de que lo que están jugando es el Grand Celesta Galaxy, un torneo creado para evitar la guerra entre los planetas, esta según se cree es debido a una crisis en un planeta muy poderoso, por culpa de la amenaza que supone la inminente succión por parte de un agujero negro de su planeta natal.

La serie manga de Inazuma Eleven, basada en la serie de videojuegos del mismo nombre, fue escrita e ilustrada por Tenya Yabuno. Se empezó a publicar en el número de junio de 2008 de la revista de Shogakukan CoroCoro Comic.

La serie de anime, continuación directa de la serie original Inazuma Eleven, comenzó a emitirse en Japón el 4 de mayo de 2011.^[1]​

Canciones de apertura

1. Ten Made Todoke! (eps 1-18), interpretada por T-Pistonz+KMC
2. Naseba Naru no sa Nanairo Tamago (eps 19-33), interpretada por T-Pistonz+KMC
3. Ohayou! Shining Day (eps 34-47), interpretada por T-Pistonz+KMC

Canciones de cierre

1. Yappa Seishun (eps 1-18), interpretada por Sorano Aoi (CV: Kitahara Sayaka)
2. Kanari Junjou (eps 19-33), interpretada por Sorano Aoi (CV: Kitahara Sayaka)
3. Hajike-Yo!! (eps 34-47), interpretada por Sorano Aoi (CV: Kitahara Sayaka)

Canciones de apertura (Temporada 2/Chrono Stone)

1. Jounetsu de Mune ATSU! (eps 1,3,5,7,9,11,13,15 & 17) interpretada por T-Pistonz+KMC
2. Kandou Kyouyuu! (eps 2,4,6,8,10,12,14,16 & 18) interpretada por T-Pistonz+KMC
3. Shoshin wo KEEP ON (eps 19-35) interpretada por T-Pistonz+KMC
4. Raimei! Blue Train! (eps 36-) interpretada por T-Pistonz+KMC

Canciones de cierre (Temporada 2/Chrono Stone)

1. Natsu ga Yattekuru (eps 1-18) interpretada por Sorano Aoi (CV:Kitahara Sayaka)
2. Te wo Tsunagou (eps 19-35) interpretada por Matsukaze Tenma (CV:Terasaki Yuka), Tsurugi Kyousuke (CV: Takashi Oohara) & Sorano Aoi (CV:Kitahara Sayaka)
3. Bokutachi no Shiro (eps 36-39,41,43-46,48-50) interpretada por Matsukaze Tenma (CV:Terasaki Yuka), Tsurugi Kyousuke(CV: Takashi Oohara), Kirino Ranmaru (CV: Kobayashi Yuu), Shindou Takuto (CV: Mitsuki Saiga)& Nishizono Shinsuke (CV: Tomatsu Haruka)
4. Seishun Oden (eps 40,42,47,51) Sorano Aoi (CV: Kitahara Sayaka), Yámana Akane (CV:Yurin), Seto Midori(CV: Mina), Nanobana Kinako(CV:Yuuki Aoi)

Canciones de apertura (Temporada 3/Galaxy)

1. Gachi de Katouze! (eps 1-17) interpretada por T-Pistonz+KMC
2. Chikyuu wo Mawase! (eps 18-32) interpretada por T-Pistonz+KMC
3. Supernova! (eps 33-?) interpretada por T-Pistonz+KMC

Canciones de cierre (Temporada 3/Galaxy)

1. Katte ni Cinderella (eps 1-17) interpretada por Sorano Aoi (CV:Kitahara Sayaka) and Morimura Konoha (CV:Yuuki Aoi )
2. Fashion☆Uchuu Senshi (eps 18-32) interpretada por Sorano Aoi (CV:Kitahara Sayaka) and Mizukawa Minori (CV: Ayahi Takagaki)
3. Arashi Tatsumaki Hurricane (eps 33-?) interpretada por Sorano Aoi (CV:Kitahara Sayaka) and Kobayashi Yuu

Inazuma Eleven GO: Kyuukyoku no Kizuna Gryphon ( イナズマイレブン GO 究極の絆 グリフォン, 'Inazuma Eleven GO: Kyuukyoku no Kizuna Gryphon'^? Inazuma Eleven GO : El Gryphon del Vínculo Definitivo) es la primera película de Inazuma Eleven GO y la segunda del universo Inazuma Eleven. La película se estrenó en los cines japoneses el 23 de diciembre de 2011.^[2]​ En su semana de estreno fue la tercera película más vista en los cines de dicho país,^[3]​ manteniéndose durante 5 semanas entre las 10 películas más vistas.^[4]​

Inazuma Eleven GO VS Danball Senki W (イナズマイレブンGO VS ダンボール戦機W, 'Inazuma Eleven GO VS Danball Senki W'^?) es la segunda película de Inazuma Eleven GO y la tercera del universo Inazuma Eleven. El filme consiste en un crossover de Inazuma Eleven GO con la franquicia Little Battlers Experience.