Data de la época de la Capitanía General de Guatemala y su construcción se inició en 1698 por mandato del corregidor Diego Rodríguez Menéndez, en el poblado indígena de Sutiaba, hoy integrado en León. El poblado había cobrado importancia a partir de 1610 cuando la casa del corregidor quedó instalada en Sutiaba. Fue terminada el 24 de agosto de 1710.^[1]​Además, en 1752 se terminó la casa Cural de Sutiaba. ^[2]​

La iglesia está considerada en muchas ocasiones la segunda iglesia en importancia de la ciudad de León por su impronta patrimonial e histórica. La cúpula quedó destruida durante la guerra de 1844, y fue reconstruida en el siglo XX.

Construida en estilo barroco novohispano, la fachada consta de cuatro cuerpos en progresión simétrica, y tiene un frontispicio de influencia barroca. La planta es de cruz latina y la nave central es de cañón corrido con tejado a dos aguas, rematado por presbiterio y capillas. El interior destaca por sus vigas de madera, labradas y decoradas. El retablo fue ensamblado por artesanos indígenas. Tiene un campanario en el lado derecho. El techo es de madera y teja.^[3]​ Se puede señalar un púlpito procedente de León Viejo además de una imagen de Santa Lucía, cuya romería el 13 de diciembre congrega a una gran cantidad de vecinos.^[4]​

Declarada Monumento Nacional e Histórico el 21 de septiembre de 1944.

Las celebraciones religiosas que más vecinos y feligreses congregan son en honor a San Jerónimo en septiembre y a Santa Lucía en diciembre respectivamente. También, con motivo de la Semana Santa en León, Nicaragua se lleva a cabo la procesión de la burrita o burriquita de Jesús del Triunfo y la del Santo Entierro, para la que se elaboran alfombras coloridas. Otra festividad religiosa es la procesión de San Lázaro y los perritos. ^[5]​