Por su importancia en la Iglesia Católica, destacan:

• San Juan Bautista
• San Juan Evangelista

Para otros santos llamados Juan

• Véase la desambiguación de San Juan

Para ver las páginas de desambiguación de las iglesias consagradas a estos santos:

• Iglesia de San Juan Bautista,    (desambiguación)
• Iglesia de San Juan Evangelista,    (desambiguación)
• Iglesia de los Santos Juanes,    (desambiguación)
• Iglesia de San Juan de Dios,    (desambiguación)
• Iglesia de San Juan de Letrán,    (desambiguación)
• Iglesia de San Juan Eudes,    (desambiguación).

Nota: Ordenadas por país, y luego por localidad/ciudad

• Iglesia de San Juan, antigua iglesia donde estaban los restos de Juan Sebastian Bach, que fue destruida en la II Guerra Mundial
• Iglesia de San Juan en Friburgo de Brisgobia

• Iglesia de San Juan, iglesia católica de Dalcahue, Chiloé, Región de Los Lagos
• Iglesia de San Juan, iglesia católica de Huaviña, Región de Tarapacá

• Iglesia de San Juan, iglesia anglicana de Chengdu, Sichuan

• Basílica de San Juan de Ávila, católica, en la localidad de   Andalucía Montilla, Córdoba
• Iglesia de San Juan (B.I.C.), iglesia católica en la localidad de   Castilla y León Aguilafuente, Segovia
• Iglesia de San Juan (B.I.C.), iglesia católica en la localidad de   Castilla y León Alba de Tormes, Salamanca
• Iglesia de San Juan, iglesia católica en la localidad de   Asturias Amandi, Asturias
• Iglesia de San Juan (B.I.C.), iglesia católica en la ciudad de   Castilla y León Ávila, Ávila
• Iglesia de San Juan (B.I.C.), iglesia católica en la ciudad de   Castilla y León Aranda de Duero, Burgos
• Iglesia de San Juan (B.I.C.), iglesia católica en la localidad de   Castilla y León Baños de Cerrato (Venta de Baños), Palencia
• Iglesia de San Juan, iglesia católica en la localidad de   Cataluña Berga, Barcelona
• Iglesia de San Juan de Busa, iglesia católica en la localidad de   Aragón Biescas, Huesca
• Iglesia de San Juan de Boí, iglesia católica en la localidad de   Cataluña Boí, Lérida —  UNESCO Patrimonio de la Humanidad—
• Iglesia de San Juan, iglesia católica del municipio de Puig-reig , Barcelona
• Iglesia de San Juan (B.I.C.), iglesia católica en la ciudad de   Castilla y León Castrojeriz, Burgos
• Iglesia de San Juan, iglesia católica en la localidad de   Castilla y León Cerezo de Arriba, Segovia
• Iglesia de San Juan (B.I.C.), iglesia católica en la ciudad de   Andalucía Córdoba, Córdoba
• Iglesia de San Juan, iglesia católica en la ciudad de   Andalucía Écija, Sevilla
• Iglesia de San Juan (B.I.C.), iglesia católica en la localidad de   Andalucía El Valle, Granada
• Iglesia de San Juan (B.I.C.), iglesia católica en la localidad de   Castilla y León Fresno el Viejo, Valladolid
• San Juan el Real, iglesia en la localidad de   Asturias Oviedo, Asturias
• Iglesia de San Juan, Iglesia desaparecida en la localidad de Ledesma, Salamanca
• Iglesia de San Juan, Iglesia desaparecida en la plaza de Ramales de Madrid
• Iglesia de San Juan, iglesia católica de la ciudad de   Andalucía Málaga, Málaga
• Iglesia de San Juan (B.I.C.), iglesia católica en la localidad de   Castilla y León Miranda de Ebro, Burgos
• Iglesia de San Juan (B.I.C.), iglesia católica en la localidad de   Castilla y León Padilla de Abajo, Burgos
• Iglesia de San Juan (B.I.C.), iglesia católica en la pedanía de   Castilla y León Rodilana (Medina Del Campo), Valladolid
• Iglesia de San Juan de Rabanera (B.I.C.), iglesia católica en la ciudad de   Castilla y León Soria
• Iglesia de San Juan de Duero (B.I.C.), iglesia católica perteneciente al monasterio Hospitalario de San Juan de Jerusalén de   Castilla y León Soria
• Iglesia de San Juan, iglesia en la localidad de   Asturias Santibánez de la Fuente (Aller), Asturias
• Iglesia de San Juan, iglesia en la localidad de Uncastillo, Zaragoza
• Iglesia de San Juan, iglesia católica en la localidad de   Castilla y León Valderas, León
• Iglesia de San Juan del Hospital, iglesia católica en la ciudad de   Comunidad Valenciana Valencia
• Iglesia de San Juan (B.I.C.), iglesia católica en la localidad de   Castilla y León Villalón de Campos, Valladolid
• Iglesia de San Juan (B.I.C.), iglesia católica en la localidad de Villaumbrales, Palencia
• Iglesia de San Juan (B.I.C.), iglesia católica en la ciudad de   Castilla y León Zamora

• Iglesia de San Juan, iglesia luterana en Helsinki

• Iglesia de San Juan Evangelista, en Filadelfia

• Archibasílica de San Juan de Letrán, basílica mayor, Catedral de Roma
• Iglesia de San Juan, iglesia en la comuna de Cavriglia (San Juan, en la Edad Media), en Arezzo, Toscana
• Iglesia de San Juan, antigua iglesia de Castro, en el Lazio, ciudad asediada, demolida y deportados todos sus habitantes por los soldados del papa

• Iglesia de San Juan Pablo II, iglesia en Keflavík

• Iglesia de San Juan Kaneo, Iglesia ortodoxa macedonia en Ohrid

• Iglesia de San Juan, iglesia en Torún (Thorn, en alemán)
• Iglesia de San Juan, iglesia en Gdansk (Danzig, en alemán)

• Iglesia de San Juan Vianney, iglesia en Peshawar

• Iglesia de San Juan Crisóstom, iglesia en Novokuznetsk