Las siguientes Iglesias de San Francisco están ordenadas por país, y luego por localidad/ciudad. Todas ellas son iglesias católicas, salvo que se indique lo contrario.

• Iglesia de San Francisco, en Salta;
• Iglesia de San Francisco de Asís, en Buenos Aires;
• Iglesia de San Francisco Javier, en Ramallo;
• Iglesia de San Francisco de Asís, en La Plata;
• Iglesia de San Francisco de Asís, en Córdoba;

• Iglesia de San Francisco, en Melbourne;

• Iglesia de San Francisco, en Cochabamba;
• Iglesia de San Francisco, en Potosí;
• Basílica de San Francisco, en La Paz;

• Iglesia de San Francisco, en João Pessoa;
• Iglesia de San Francisco, en São Paulo

• Iglesia de San Francisco, en Ancud, Chiloé;
• Iglesia de San Francisco, en Castro, Chiloé;
• Iglesia de San Francisco, en Chiu Chiu;
• Iglesia de San Francisco, en Copiapó;
• Iglesia de San Francisco, en Curicó;
• Iglesia de San Francisco, en Quillota;
• Iglesia de San Francisco, en La Serena;
• Iglesia de San Francisco, en San Fernando;
• Iglesia de San Francisco, en Santiago;
• Iglesia de San Francisco, en Socoroma;
• Iglesia de San Francisco, en Valdivia;
• Iglesia de San Francisco, en Valparaíso;
• Iglesia de San Francisco de Asís, en Rancagua;
• Iglesia de San Francisco de Borja, en Santiago;
• Iglesia de San Francisco Javier, en Taltal;

• Iglesia de San Francisco, en Bogotá;
• Iglesia de San Francisco, en Popayán;
• Iglesia de San Francisco, en Santiago de Cali;
• Iglesia de San Francisco, en Rionegro;
• Iglesia de San Francisco, en Guadalajara de Buga;
• Iglesia de San Francisco, en Santa Marta;

• Iglesia de San Francisco de Asís, en La Habana;
• Iglesia de San Francisco Javier Marianao, La Habana.

• Iglesia de San Francisco, en Guayaquil;
• Iglesia de San Francisco, en Loja;
• Iglesia de San Francisco, en Quito;

• Iglesia de San Francisco (B.I.C. 05/06/1973), en Antequera, Málaga;
• Iglesia de San Francisco (B.I.C. 04/06/1931), en Ayamonte, Huelva;
• Iglesia de San Francisco (B.I.C. 05/03/1983), en Baena, Córdoba;
• Iglesia de San Francisco (B.I.C. 04/06/1931), en Baeza, Jaén;
• Iglesia de San Francisco, en Bujalance, Córdoba;
• Iglesia de San Francisco, en Cádiz;
• Iglesia de San Francisco (B.I.C. 24/03/1982), en Córdoba, Córdoba;
• Iglesia de San Francisco (B.I.C. 24/03/1982), en Fuente Obejuna, Córdoba;
• Iglesia de San Francisco (B.I.C. 12/07/1983), en Guadix, Granada;
• Iglesia de San Francisco, en Loja, Granada;
• Iglesia de San Francisco (B.I.C. 16/7/1977), en Montilla, Córdoba;
• Iglesia de San Francisco de Asís (B.I.C. 27/09/2001), en Morón de la Frontera, Sevilla;
• Iglesia de San Francisco (B.I.C. 04/06/2003), en Priego de Córdoba, Córdoba;
• Iglesia de San Francisco (B.I.C. 11/11/1982), en Sanlúcar de Barrameda, Cádiz;

• Iglesia de San Francisco, en Avilés, Asturias;

• Iglesia de San Francisco de Asís en Las Palmas de Gran Canaria, Las Palmas;
• Iglesia de San Francisco de Asís en Santa Cruz de Tenerife, Santa Cruz de Tenerife;
• Iglesia de San Francisco, en Santa Cruz de La Palma, Santa Cruz de Tenerife.

• Iglesia de San Francisco (B.I.C. 17/12/1992), en Palencia;
• Iglesia de San Francisco de Asís (B.I.C. 07/04/1993), en Villafranca del Bierzo, León;
• Iglesia de San Francisco de Asís en Valladolid, Valladolid;
• Iglesia de San Francisco en León, León

• Iglesia de San Francisco, (B.I.C. 30/03/1993), en Talavera de la Reina, Toledo;

• Iglesia de San Francisco, en Santander;

• Iglesia de San Francisco Javier, (B.I.C. 12/02/2004), en Cáceres;

• Iglesia de San Francisco, en Betanzos, La Coruña;
• Iglesia de San Francisco, en La Coruña;
• Iglesia de San Francisco, en Vigo;
• Iglesia de San Francisco, en Vivero, Lugo;

• Iglesia de San Francisco el Grande, en Madrid;
• Iglesia de San Francisco Javier, en Pinto, Madrid;

• Iglesia de San Francisco de Asís, en Liria, Valencia;

• Iglesia de San Francisco, en Lorca;
• Parroquia de San Francisco de Asís, en Murcia

• Iglesia de San Francisco de Asís, en Bilbao;
• Iglesia de San Francisco de Asís, en Vitoria;

• Iglesia de San Francisco de Sales, en Detroit;

• Iglesia de San Francisco El Grande, en Antigua Guatemala;
• Iglesia de San Francisco, en la Ciudad de Guatemala

• Iglesia de San Francisco, en Comayagua

• Basílica o Iglesia de San Francisco de Asís, en Asís;
• Iglesia de San Francisco, en Ferrara;
• Iglesia de San Francisco, en Florencia;
• Iglesia de San Francisco, en Pisa;
• Iglesia de San Francisco, en Lucca;
• Iglesia de San Francisco, en Rímini;

• Iglesia de San Francisco, en Riga;

• Iglesia de San Francisco, en San Francisco de Campeche;
• Iglesia de San Francisco el Grande, en Ciudad de México;
• Iglesia de San Francisco, en Morelia;
• Iglesia de San Francisco, en Guadalajara;
• Iglesia de San Francisco, en Pachuca de Soto;
• Iglesia de San Francisco, en Puebla de Zaragoza;
• Iglesia de San Francisco, en Santiago de Querétaro;
• Templo de san Francisco, en San Luis Potosí;
• Iglesia de San Francisco, en Zacatecas
• Iglesia de San Francisco, en Sombrerete, Zacatecas.
• Templo de San Francisco, en Celaya.

• Iglesia de San Francisco, en Granada.

• Iglesia de San Francisco, en Lima;
• Iglesia de San Francisco, en Cajamarca;
• Iglesia de San Francisco, en Cusco.

• Iglesia de San Francisco, en Oporto;

• Iglesia de San Francisco, en San Marino;

• Iglesia de San Francisco, en Jönköping;

• Iglesia de San Francisco de Asís, en Ciudad Vieja (Montevideo);

• Iglesia de San Francisco, en Caracas;
• Iglesia de San Francisco, en Coro.