Jean-Claude Habib Bourguiba era hijo de Habib Bourguiba, que se convirtió en el primer Presidente de Túnez en 1957 y de su primera mujer Mathilde Lorrain. Su primer cargo fue el de embajador de Túnez en Francia en noviembre de 1958. Posteriormente, ocupó las embajadas de Estados Unidos e Italia.

En 1964, Bourguiba sustituyó a Mongi Slim como ministro de Asuntos Exteriores, puesto que ocupó hasta 1970. Asistió a la celebración del cumpleaños del rey Hassan II de Marruecos el 10 de julio de 1971 cuando M'hamed Ababou y Mohamed Medbouh lanzaron un golpe de Estado contra el rey. Una granada cayó a los pies de Hassan, Bourguiba la arrojó hacia atrás antes de que pudiera detonar, probablemente salvando la vida del Rey.^[2]​ Pasó un corto tiempo por el ministerio de Justicia hasta noviembre de 1970 antes de ser derrocado tras el asunto cooperativo.^[3]​

Bourguiba fundó el Banco Internacional Árabe de Túnez con Mansour Moalla en 1976.^[4]​ Posteriormente, su padre lo nombró consejero en 1977. Fue destituido de este cargo como parte del golpe de Estado del 7 de noviembre de 1987 que derrocó la administración de su padre y llevó a Zine El Abidine Ben Ali al poder.

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