En 1860 fue designado director de la colección de peces del Museo de Historia Natural de Viena. En 1868, habiendo acumulado notable fama, fue llamado a la Universidad de Cambridge en Boston (Estados Unidos). De vuelta a Viena, fue nombrado director de zoología del referido museo en 1887, y pasó finalmente a dirigirlo a partir de 1898, cuando fue nombrado director.

Dio fama y categoría de primer nivel a la colección del Museo de Historia Natural de Viena. Dicha colección fue ampliada a partir de envíos que proporcionaban los oficiales del ejército austriaco y por adquisiciones del propio Steindachner.

Él mismo condujo sus propias expediciones a América, África y Oriente Medio, siendo las más notables las del Mar Rojo, en 1895, y la de Brasil de 1903. Publicó más de sesenta obras sobre su especialidad.

• 1876. Ichthyologische Beiträge (V). [Subtitles i–v.]. Sitzungsber. Akad. Wiss. Viena 74 (1. Abth.) : 49–240, Pl. 1–15
• 1877. Die Süßwasserfische des südöstlichen Brasilien, Viena.
• 1880. Beitäge zur Kenntniss der Flussfische Südamerikas (II) und Ichthyologische Beiträge (IX). Anz. Akad. Wiss. Viena 17 (n.° 19) : 157–159.
• 1901. Geschichte des Zoologie in Österreich von 1850 bis 1900. Fische. 407-443, In: Botanik und Zoologie in Österreich in den Jahren 1850 bis 1900. Festschrift herausgegeben von der K.K. Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien anlässilich der Feier ihres fünfzigjährigen Bestandes. Alfred Hölder. Viena.
• 1908. Über drei neue Characinen und drei Siluroiden aus dem Stromgebiete des Amazonas innerhalb Brasilien, Viena.

Géneros

• Steindachneridion, genus de pez de Sudamérica descubierto por Steindachner^[1]​

• Steindachnerina, genus de pez de Sudamérica.^[2]​

• Steindachneria, genus de pez del Atlántico oeste;^[3]​ (Steindachneria argentea).

Especies

ocho especies y una subespecie de reptiles: Amphisbaena steindachneri, Chelodina steindachneri, Diplodactylus steindachneri, Kinosternon subrubrum steindachneri, Lioscincus steindachneri, Micrurus steindachneri, Palea steindachneri, Phrynocephalus steindachneri, Pseudalsophis steindachneri.^[4]​

La abreviatura Steindachner se emplea para indicar a Franz Steindachner como autoridad en la descripción y taxonomía en zoología.

• Kraig Adler. 1989. Contributions to the History of Herpetology, Society for the study of amphibians and reptiles : 202 p. ISBN 0-916984-19-2

• Barbara Herzig-Straschil. 1997. Franz Steindachner (1834-1919) and Other Prime Contributors to the Ichthyological Collection of the Naturhistorisches Museum Wien, Collection building in ichthyology and herpetology (Theodore W. Pietsch et William D. Anderson dir.) Special publication 3, Am. Soc. of Ichthyologists and Herpetologists : 101-108 ISBN 0-935858-91-7

• Jean Lescure, Bernard Le Garff. L'étymologie des noms d'amphibiens et de reptiles. Ed. Belin, 2006. ISBN 2-7011-4142-7

• Franz Tiedemann, Heinz Grillitsch. 1997. A History of the Herpetological Collection at the Naturhistorisches Museum Wien, Collection building in ichthyology and herpetology (Theodore W. Pietsch et William D. Anderson dir.) Special publication 3, Am. Soc. of Ichthyologists and Herpetologists : 108-114 ISBN 0-935858-91-7

• Bibliografía relacionada con Franz Steindachner en el catálogo de la Biblioteca Nacional de Alemania.

La abreviatura Steindachner se emplea para indicar a Franz Steindachner como autoridad en la descripción y taxonomía en zoología.